seq1 = pF1KE6343.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KE6343/gi568815583r_68108143.tfa (gi568815583r:68108143_68329584), 221442 bp

>pF1KE6343 933
>gi568815583r:68108143_68329584 (Chr15)

(complement)

1-83  (100001-100083)   100% ->
84-198  (110935-111049)   100% ->
199-297  (115197-115295)   100% ->
298-486  (117722-117910)   100% ->
487-542  (118267-118322)   100% ->
543-665  (119826-119948)   100% ->
666-933  (121175-121442)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCGACGCGGAGGCGGCAGCACCTGGGAGCGACGGGCGGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCGACGCGGAGGCGGCAGCACCTGGGAGCGACGGGCGGCCCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGCAGCTGGGCGCCTCCTTCCTGCAGGCCAG         GCATGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100051 CGCGCAGCTGGGCGCCTCCTTCCTGCAGGCCAGGTG...CAGGCATGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGTGAGCGCTGATGAGGCTGCCCGCACGGCTCCCTTCCACCTCGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110943 CTGTGAGCGCTGATGAGGCTGCCCGCACGGCTCCCTTCCACCTCGACCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGTTCTACTTCACACTGCAGAACTGGGTTCTGGACTTTGGGCGTCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110993 TGGTTCTACTTCACACTGCAGAACTGGGTTCTGGACTTTGGGCGTCCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCCATG         CTGGTATTCCCTCTCGAGTGGTTTCCACTCAACA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111043 TGCCATGGTG...CAGCTGGTATTCCCTCTCGAGTGGTTTCCACTCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCCCAGTGTTGGGGACTACTTCCACATGGCCTACAACGTCATCACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115231 AGCCCAGTGTTGGGGACTACTTCCACATGGCCTACAACGTCATCACGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTCTCTTGCTCAAG         CTCATCGAGCGGTCCCCCCGCACCCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 115281 TTTCTCTTGCTCAAGGTA...CAGCTCATCGAGCGGTCCCCCCGCACCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCCACGCTCCATCACGTACGTGAGCATCATCATCTTCATCATGGGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117748 GCCACGCTCCATCACGTACGTGAGCATCATCATCTTCATCATGGGTGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCATCCACCTGGTGGGTGACTCTGTCAACCACCGCCTGCTCTTCAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117798 GCATCCACCTGGTGGGTGACTCTGTCAACCACCGCCTGCTCTTCAGTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACCAGCACCACCTGTCTGTCCGTGAGAACCCCATCATCAAGAATCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117848 TACCAGCACCACCTGTCTGTCCGTGAGAACCCCATCATCAAGAATCTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCCGGAGACGCTG         ATCGACTCCTTTGAGCTGCTCTACTATT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 117898 GCCGGAGACGCTGGTG...CAGATCGACTCCTTTGAGCTGCTCTACTATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGATGAGTACCTGGGTCACTGCATGTG         GTACATCCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 118295 ATGATGAGTACCTGGGTCACTGCATGTGGTG...CAGGTACATCCCCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTCCTCATCCTCTTCATGTACTTCAGCGGCTGCTTTACTGCCTCTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119839 TTCCTCATCCTCTTCATGTACTTCAGCGGCTGCTTTACTGCCTCTAAAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGAGAGCTTGATTCCAGGGCCTGCCCTGCTCCTGGTGGCACCCAGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119889 TGAGAGCTTGATTCCAGGGCCTGCCCTGCTCCTGGTGGCACCCAGTGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGTACTACTG         GTACCTGGTCACCGAGGGCCAGATCTTCATC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 119939 TGTACTACTGGTG...CAGGTACCTGGTCACCGAGGGCCAGATCTTCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTCTTCATCTTCACCTTCTTCGCCATGCTGGCCCTCGTCCTGCACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121206 CTCTTCATCTTCACCTTCTTCGCCATGCTGGCCCTCGTCCTGCACCAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCGCAAGCGCCTCTTCCTGGACAGCAACGGCCTCTTCCTCTTCTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121256 GCGCAAGCGCCTCTTCCTGGACAGCAACGGCCTCTTCCTCTTCTCCTCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCGCACTGACCCTCTTGCTTGTGGCGCTCTGGGTCGCCTGGCTGTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121306 TCGCACTGACCCTCTTGCTTGTGGCGCTCTGGGTCGCCTGGCTGTGGAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GACCCTGTTCTCAGGAAGAAGTACCCGGGTGTCATCTACGTCCCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121356 GACCCTGTTCTCAGGAAGAAGTACCCGGGTGTCATCTACGTCCCTGAGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .
    897 CTGGGCTTTCTACACCCTTCACGTCAGCAGTCGGCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121406 CTGGGCTTTCTACACCCTTCACGTCAGCAGTCGGCAC