seq1 = pF1KE6330.tfa, 1170 bp
seq2 = pF1KE6330/gi568815587r_124653649.tfa (gi568815587r:124653649_124862154), 208506 bp

>pF1KE6330 1170
>gi568815587r:124653649_124862154 (Chr11)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-249  (103628-103806)   100% ->
250-451  (105413-105614)   100% ->
452-607  (105793-105948)   100% ->
608-730  (107392-107514)   100% ->
731-857  (107815-107941)   100% ->
858-1170  (108194-108506)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTTCCCTCCCGGGGCCCCTGGTGACCAACTTGCTGCGGTTTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTTCCCTCCCGGGGCCCCTGGTGACCAACTTGCTGCGGTTTTTGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGGGCTGAGTGCCCTCG         CGCCCCCCTCGCGGGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGGGCTGAGTGCCCTCGGTG...CAGCGCCCCCCTCGCGGGCCCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCAACTGCACTTGCCCGCCAACCGGTTGCAGGCGGTGGAGGGAGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103649 TGCAACTGCACTTGCCCGCCAACCGGTTGCAGGCGGTGGAGGGAGGGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGGTGCTTCCAGCGTGGTACACCTTGCACGGGGAGGTGTCTTCATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103699 GTGGTGCTTCCAGCGTGGTACACCTTGCACGGGGAGGTGTCTTCATCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCATGGGAGGTGCCCTTTGTGATGTGGTTCTTCAAACAGAAAGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103749 GCCATGGGAGGTGCCCTTTGTGATGTGGTTCTTCAAACAGAAAGAAAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGATCAG         GTGTTGTCCTACATCAATGGGGTCACAACAAGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 103799 AGGATCAGGTG...CAGGTGTTGTCCTACATCAATGGGGTCACAACAAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAACCTGGAGTATCCTTGGTCTACTCCATGCCCTCCCGGAACCTGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105446 AAACCTGGAGTATCCTTGGTCTACTCCATGCCCTCCCGGAACCTGTCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCGGCTGGAGGGTCTCCAGGAGAAAGACTCTGGCCCCTACAGCTGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105496 GCGGCTGGAGGGTCTCCAGGAGAAAGACTCTGGCCCCTACAGCTGCTCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGAATGTGCAAGACAAACAAGGCAAATCTAGGGGCCACAGCATCAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105546 TGAATGTGCAAGACAAACAAGGCAAATCTAGGGGCCACAGCATCAAAACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTAGAACTCAATGTACTGG         TTCCTCCAGCTCCTCCATCCTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105596 TTAGAACTCAATGTACTGGGTG...CAGTTCCTCCAGCTCCTCCATCCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCGTCTCCAGGGTGTGCCCCATGTGGGGGCAAACGTGACCCTGAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105815 CCGTCTCCAGGGTGTGCCCCATGTGGGGGCAAACGTGACCCTGAGCTGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGTCTCCAAGGAGTAAGCCCGCTGTCCAATACCAGTGGGATCGGCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105865 AGTCTCCAAGGAGTAAGCCCGCTGTCCAATACCAGTGGGATCGGCAGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCATCCTTCCAGACTTTCTTTGCACCAGCATTAG         ATGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 105915 CCATCCTTCCAGACTTTCTTTGCACCAGCATTAGGTG...CAGATGTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCGTGGGTCTTTAAGCCTCACCAACCTTTCGTCTTCCATGGCTGGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107399 CCGTGGGTCTTTAAGCCTCACCAACCTTTCGTCTTCCATGGCTGGAGTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGTCTGCAAGGCCCACAATGAGGTGGGCACTGCCCAATGTAATGTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107449 ATGTCTGCAAGGCCCACAATGAGGTGGGCACTGCCCAATGTAATGTGACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGGAAGTGAGCACAG         GGCCTGGAGCTGCAGTGGTTGCTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 107499 CTGGAAGTGAGCACAGGTC...CAGGGCCTGGAGCTGCAGTGGTTGCTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGCTGTTGTGGGTACCCTGGTTGGACTGGGGTTGCTGGCTGGGCTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107840 AGCTGTTGTGGGTACCCTGGTTGGACTGGGGTTGCTGGCTGGGCTGGTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCTTGTACCACCGCCGGGGCAAGGCCCTGGAGGAGCCAGCCAATGATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107890 TCTTGTACCACCGCCGGGGCAAGGCCCTGGAGGAGCCAGCCAATGATATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AA         GGAGGATGCCATTGCTCCCCGGACCCTGCCCTGGCCCAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107940 AAGTA...TAGGGAGGATGCCATTGCTCCCCGGACCCTGCCCTGGCCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GAGCTCAGACACAATCTCCAAGAATGGGACCCTTTCCTCTGTCACCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108233 GAGCTCAGACACAATCTCCAAGAATGGGACCCTTTCCTCTGTCACCTCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CACGAGCCCTCCGGCCACCCCATGGCCCTCCCAGGCCTGGTGCATTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108283 CACGAGCCCTCCGGCCACCCCATGGCCCTCCCAGGCCTGGTGCATTGACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CCCACGCCCAGTCTCTCCAGCCAGGCCCTGCCCTCACCAAGACTGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108333 CCCACGCCCAGTCTCTCCAGCCAGGCCCTGCCCTCACCAAGACTGCCCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GACAGATGGGGCCCACCCTCAACCAATATCCCCCATCCCTGGTGGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108383 GACAGATGGGGCCCACCCTCAACCAATATCCCCCATCCCTGGTGGGGTTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CTTCCTCTGGCTTGAGCCGCATGGGTGCTGTGCCTGTGATGGTGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108433 CTTCCTCTGGCTTGAGCCGCATGGGTGCTGTGCCTGTGATGGTGCCTGCC

   1200     .    :    .    :
   1147 CAGAGTCAAGCTGGCTCTCTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||
 108483 CAGAGTCAAGCTGGCTCTCTGGTA