seq1 = pF1KE6327.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KE6327/gi568815582r_21158784.tfa (gi568815582r:21158784_21378251), 219468 bp

>pF1KE6327 942
>gi568815582r:21158784_21378251 (Chr16)

(complement)

1-170  (100001-100170)   100% ->
171-324  (100668-100821)   100% ->
325-387  (102658-102720)   100% ->
388-489  (108361-108462)   100% ->
490-673  (110515-110698)   100% ->
674-795  (116094-116215)   100% ->
796-880  (116914-116998)   98% ->
881-942  (119407-119468)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCGGGTACCAGCGTTCCTGAGCGCGGCCGAGGTGGAGGAACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCGGGTACCAGCGTTCCTGAGCGCGGCCGAGGTGGAGGAACACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCAGCTCCAGCCTCCTCATCCCGCCTCTAGAGACGGCCCTGGCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCAGCTCCAGCCTCCTCATCCCGCCTCTAGAGACGGCCCTGGCCAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCAGCGGTCCCGAAGGAGGGGTCATGCAGCCCGTGCGCACCGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTCCAGCGGTCCCGAAGGAGGGGTCATGCAGCCCGTGCGCACCGTGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGGTGACCAAGCACAGGGG         CTACCTGGGGGTCATGCCCGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100151 CCGGTGACCAAGCACAGGGGGTG...TAGCTACCTGGGGGTCATGCCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTACAGTGCTGCAGAGGATGCACTGACCACCAAGTTGGTCACCTTCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100689 CTACAGTGCTGCAGAGGATGCACTGACCACCAAGTTGGTCACCTTCTACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGACCGCGGCATCACCTCGGTCGTCCCTTCCCACCAGGCTACTGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100739 AGGACCGCGGCATCACCTCGGTCGTCCCTTCCCACCAGGCTACTGTGCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCTTTGAGCCCAGCAATGGCACCCTGCTGGCG         GTCATGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100789 CTCTTTGAGCCCAGCAATGGCACCCTGCTGGCGGTG...AAGGTCATGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGAAATGTCATAACTGCAAAGAGAACAGCTGCAGTTTCTGCCATTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102666 TGGAAATGTCATAACTGCAAAGAGAACAGCTGCAGTTTCTGCCATTGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCAAG         TTTCTGAAACCTCCCAGCAGTGAAGTGCTGTGCATC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102716 CCAAGGTA...TAGTTTCTGAAACCTCCCAGCAGTGAAGTGCTGTGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTTGGGGCTGGGGTCCAGGCCTACAGCCATTATGAGATCTTCACAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108397 CTTGGGGCTGGGGTCCAGGCCTACAGCCATTATGAGATCTTCACAGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTCTCCTTTAAGGAG         GTGAGGATATGGAACCGCACCAAAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 108447 GTTCTCCTTTAAGGAGGTA...AAGGTGAGGATATGGAACCGCACCAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAAATGCAGAGAAGTTTGCAGACACAGTGCAAGGAGAGGTACGGGTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110540 AAAATGCAGAGAAGTTTGCAGACACAGTGCAAGGAGAGGTACGGGTCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCTTCGGTCCAGGAGGCTGTGGCAGGTGCAGATGTGATCATCACAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110590 TCTTCGGTCCAGGAGGCTGTGGCAGGTGCAGATGTGATCATCACAGTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTGGCAACAGAGCCCATTTTGTTTGGTGAATGGGTGAAGCCAGGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110640 CCTGGCAACAGAGCCCATTTTGTTTGGTGAATGGGTGAAGCCAGGGGCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACATCAATG         CTGTTGGAGCCAGCAGACCTGACTGGAGAGAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110690 ACATCAATGGTA...TAGCTGTTGGAGCCAGCAGACCTGACTGGAGAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGGATGATGAGCTCATGAAAGAAGCTGTGCTGTACGTGGATTCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116126 CTGGATGATGAGCTCATGAAAGAAGCTGTGCTGTACGTGGATTCCCAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGCTGCCCTGAAGGAGTCTGGAGATGTCCTGCTGTCAGGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 116176 GGCTGCCCTGAAGGAGTCTGGAGATGTCCTGCTGTCAGGGGTG...TAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCGAGATCTTTGCTGAGCTGGGAGAAGTGATTAAGGGAGTGAAACCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116915 CCGAGATCTTTGCTGAGCTGGGAGAAGTGATTAAGGGAGTGAAACCAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CACTGTGAGAAGACCACGGTGTTCAAGTCTTTGG         GAATGGC
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 116965 CACTGTGAGAAGACCACCGTGTTCAAGTCTTTGGGTA...TAGGAATGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGTGGAAGACACAGTTGCAGCCAAACTCATCTATGATTCCTGGTCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119414 AGTGGAAGACACAGTTGCAGCCAAACTCATCTATGATTCCTGGTCATCTG

   1000     .
    938 GTAAA
        |||||
 119464 GTAAA