seq1 = pF1KE6305.tfa, 1230 bp
seq2 = pF1KE6305/gi568815588r_99614590.tfa (gi568815588r:99614590_99832049), 217460 bp

>pF1KE6305 1230
>gi568815588r:99614590_99832049 (Chr10)

(complement)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-272  (102316-102497)   100% ->
273-395  (104487-104609)   100% ->
396-582  (104896-105082)   100% ->
583-750  (107927-108094)   100% ->
751-832  (110982-111063)   100% ->
833-987  (113550-113704)   100% ->
988-1101  (115589-115702)   100% ->
1102-1230  (117332-117460)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCGATTGCTCTTTCCGCCGTTGAGGGCCTTGAAGGGGAGGCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCGATTGCTCTTTCCGCCGTTGAGGGCCTTGAAGGGGAGGCAGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGCCGCTCCTGGCTCCTAGGGCAGCGCCTAGAGCACAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 TCTGCCGCTCCTGGCTCCTAGGGCAGCGCCTAGAGCACAGGTA...TAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGATTGCATCAGGCGCCCTTTGAGGCCAGGGCAATACAGCACCATCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102317 GTGATTGCATCAGGCGCCCTTTGAGGCCAGGGCAATACAGCACCATCTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGTAGCTTTGCAATCTGGAAGGGGTACAGTGTCCCTTCCCTCAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102367 GAAGTAGCTTTGCAATCTGGAAGGGGTACAGTGTCCCTTCCCTCAAAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCTGAGCGGGTGGTGGGCCGATGGCTCCTGGTCTGCAGTGGAACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102417 TGCTGAGCGGGTGGTGGGCCGATGGCTCCTGGTCTGCAGTGGAACAGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGGAGCAGTTATTCTTGGTGGAGTAACTAG         GTTGACAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102467 CTGGAGCAGTTATTCTTGGTGGAGTAACTAGGTA...AAGGTTGACAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCTGGCCTCTCGATGGTAGATTGGCATTTAATAAAGGAGATGAAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104497 TCTGGCCTCTCGATGGTAGATTGGCATTTAATAAAGGAGATGAAGCCACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TACAAGCCAAGAGGAATGGGAAGCAGAATTCCAAAGATACCAGCAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104547 TACAAGCCAAGAGGAATGGGAAGCAGAATTCCAAAGATACCAGCAATTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAGAATTTAAAAT         CTTGAATCATGATATGACACTGACAGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104597 CAGAATTTAAAATGTA...CAGCTTGAATCATGATATGACACTGACAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCAAGTTCATCTGGTACATGGAGTACTCACACCGAATGTGGGGTCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104924 TTCAAGTTCATCTGGTACATGGAGTACTCACACCGAATGTGGGGTCGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTAGGCCTTGTGTACATCCTGCCTGCTGCCTACTTTTGGAGAAAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104974 TGTAGGCCTTGTGTACATCCTGCCTGCTGCCTACTTTTGGAGAAAGGGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGCTCAGCCGTGGCATGAAAGGACGTGTTCTTGCCCTCTGTGGCCTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105024 GGCTCAGCCGTGGCATGAAAGGACGTGTTCTTGCCCTCTGTGGCCTCGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGCTTCCAG         GGTCTGTTGGGATGGTATATGGTGAAAAGTGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105074 TGCTTCCAGGTA...TAGGGTCTGTTGGGATGGTATATGGTGAAAAGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACTAGAAGAAAAATCAGACTCCCATGACATCCCTCGGGTCAGTCAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107959 ACTAGAAGAAAAATCAGACTCCCATGACATCCCTCGGGTCAGTCAGTACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCCTTGCTGCCCACCTGGGATCAGCCCTGGTTCTTTATTGTGCCAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108009 GCCTTGCTGCCCACCTGGGATCAGCCCTGGTTCTTTATTGTGCCAGCTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TGGACCTCACTGTCACTGCTACTCCCTCCGCACAAG         TTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 108059 TGGACCTCACTGTCACTGCTACTCCCTCCGCACAAGGTA...TAGTTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAAACCCACCAACTCCTACAGTTGAGACGATTTGCTCATGGAACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110987 TGAAACCCACCAACTCCTACAGTTGAGACGATTTGCTCATGGAACAGCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GTCTGGTGTTCCTTACGGCCCTCTCAG         GGGCTTTTGTGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 111037 GTCTGGTGTTCCTTACGGCCCTCTCAGGTA...CAGGGGCTTTTGTGGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGGCTAGATGCTGGGCTTGTTTATAACTCCTTTCCCAAAATGGGAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113564 GGGCTAGATGCTGGGCTTGTTTATAACTCCTTTCCCAAAATGGGAGAATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTGGATCCCGGAGGACCTCTTTACCTTCTCCCCCATCCTGAGGAATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113614 CTGGATCCCGGAGGACCTCTTTACCTTCTCCCCCATCCTGAGGAATGTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTGAGAATCCCACCATGGTGCAGTTTGATCACCGGATTCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 113664 TTGAGAATCCCACCATGGTGCAGTTTGATCACCGGATTCTGGTA...CAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGAATCACTTCAGTCACTGCCATTACAGTGCTCTACTTCCTCTCTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115589 GGAATCACTTCAGTCACTGCCATTACAGTGCTCTACTTCCTCTCTCGGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AATTCCCCTTCCTAGAAGGACCAAGATGGCAGCAGTGACTCTGCTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115639 AATTCCCCTTCCTAGAAGGACCAAGATGGCAGCAGTGACTCTGCTGGCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGGCGTATACACAG         GTGGGCTTGGGCATCAGCACGCTGCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 115689 TGGCGTATACACAGGTA...CAGGTGGGCTTGGGCATCAGCACGCTGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ATGTATGTCCCAACTCCTCTGGCCGCCACTCACCAGTCAGGCTCCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117359 ATGTATGTCCCAACTCCTCTGGCCGCCACTCACCAGTCAGGCTCCTTGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TTTGCTCACTGGTGCTCTTTGGCTGATGAATGAACTCCGAAGAGTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117409 TTTGCTCACTGGTGCTCTTTGGCTGATGAATGAACTCCGAAGAGTCCCAA

   1300 
   1229 AA
        ||
 117459 AA