seq1 = pF1KE6302.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KE6302/gi568815576r_19076133.tfa (gi568815576r:19076133_19278625), 202493 bp

>pF1KE6302 933
>gi568815576r:19076133_19278625 (Chr22)

(complement)

1-94  (99953-100046)   100% ->
95-202  (100386-100493)   100% ->
203-302  (100585-100684)   100% ->
303-441  (100761-100899)   100% ->
442-526  (101422-101506)   100% ->
527-631  (101676-101780)   100% ->
632-747  (101933-102048)   100% ->
748-821  (102132-102205)   100% ->
822-933  (102382-102493)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGCGCCCCGCGCCCCGCGCGCTCTGGCGGCCGCCGCGCCCGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99953 ATGCCCGCGCCCCGCGCCCCGCGCGCTCTGGCGGCCGCCGCGCCCGCGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGAAGGCCAAGCTGACGCACCCGGGGAAGGCGATCCTGGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100003 CGGGAAGGCCAAGCTGACGCACCCGGGGAAGGCGATCCTGGCAGGTG...

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     95    GCGGCCTGGCGGGTGGCATCGAGATCTGCATCACCTTCCCCACCGAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100383 CAGGCGGCCTGGCGGGTGGCATCGAGATCTGCATCACCTTCCCCACCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACGTGAAGACGCAGCTGCAGCTGGACGAGCGCTCGCACCCGCCGCGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100433 TACGTGAAGACGCAGCTGCAGCTGGACGAGCGCTCGCACCCGCCGCGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGGGGCATCG         GGGACTGCGTGCGGCAGACGGTTCGCAGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100483 CCGGGGCATCGGTG...CAGGGGACTGCGTGCGGCAGACGGTTCGCAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGGCGTCCTGGGCCTGTACCGCGGCCTTAGCTCCCTGCTCTACGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100615 ATGGCGTCCTGGGCCTGTACCGCGGCCTTAGCTCCCTGCTCTACGGTTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCCCCAAGGCGGCCGTCAG         GTTTGGAATGTTCGAGTTCCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100665 ATCCCCAAGGCGGCCGTCAGGTG...CAGGTTTGGAATGTTCGAGTTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAGCAACCACATGCGGGATGCCCAGGGACGGCTGGACAGCACGCGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100782 CAGCAACCACATGCGGGATGCCCAGGGACGGCTGGACAGCACGCGTGGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGCTGTGCGGCCTGGGCGCTGGCGTGGCCGAGGCCGTGGTGGTCGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100832 TGCTGTGCGGCCTGGGCGCTGGCGTGGCCGAGGCCGTGGTGGTCGTGTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCCATGGAGACCATCAAG         GTGAAGTTCATCCACGACCAGAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100882 CCCATGGAGACCATCAAGGTG...CAGGTGAAGTTCATCCACGACCAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTCCCCAAACCCCAAGTACAGAGGATTCTTCCACGGGGTTAGGGAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101445 CTCCCCAAACCCCAAGTACAGAGGATTCTTCCACGGGGTTAGGGAGATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGCGGGAACAAG         GGCTGAAGGGGACGTACCAGGGCCTCACA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101495 TGCGGGAACAAGGTG...CAGGGCTGAAGGGGACGTACCAGGGCCTCACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCCACTGTCCTGAAGCAGGGCTCGAACCAGGCCATCCGCTTCTTCGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101705 GCCACTGTCCTGAAGCAGGGCTCGAACCAGGCCATCCGCTTCTTCGTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GACCTCCCTGCGCAACTGGTACCGAG         GGGACAACCCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101755 GACCTCCCTGCGCAACTGGTACCGAGGTG...CAGGGGACAACCCCAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGCCCATGAACCCTCTGATCACTGGGGTCTTCGGAGCTATTGCAGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101948 AGCCCATGAACCCTCTGATCACTGGGGTCTTCGGAGCTATTGCAGGCGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCCAGTGTCTTTGGAAACACTCCTCTGGATGTGATTAAGACCCGGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101998 GCCAGTGTCTTTGGAAACACTCCTCTGGATGTGATTAAGACCCGGATGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 G         GGCCTGGAGGCGCACAAATACCGGAACACGTGGGACTGCG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102048 GGTG...TAGGGCCTGGAGGCGCACAAATACCGGAACACGTGGGACTGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GCTTGCAGATCCTGAAGAAGGAGGGGCTCAAGGC         ATTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102172 GCTTGCAGATCCTGAAGAAGGAGGGGCTCAAGGCGTG...CAGATTCTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAGGGCACTGTCCCCCGCCTGGGCCGGGTCTGCCTGGATGTGGCCATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102389 AAGGGCACTGTCCCCCGCCTGGGCCGGGTCTGCCTGGATGTGGCCATAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GTTTGTCATCTATGATGAAGTGGTGAAGCTGCTCAACAAAGTGTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102439 GTTTGTCATCTATGATGAAGTGGTGAAGCTGCTCAACAAAGTGTGGAAGA

   1000     .
    929 CGGAC
        |||||
 102489 CGGAC