seq1 = pF1KE6296.tfa, 549 bp
seq2 = pF1KE6296/gi568815575r_30971405.tfa (gi568815575r:30971405_31171953), 200549 bp

>pF1KE6296 549
>gi568815575r:30971405_31171953 (ChrX)

(complement)

1-549  (100001-100549)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACCGCCCAGCCGTCGCAGGTGCGCCAGAAGTACGACACCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACCGCCCAGCCGTCGCAGGTGCGCCAGAAGTACGACACCAACTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACGCCGCCATCAACAGCCACATCACGCTGGAGCTCTACACCTCCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACGCCGCCATCAACAGCCACATCACGCTGGAGCTCTACACCTCCTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGTCTATGGCCTTCTACTTCAACCGGGACGACGTGGCCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGTCTATGGCCTTCTACTTCAACCGGGACGACGTGGCCCTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACTTCTTCCGCTACTTCCTGCGCCTGTCGGACGACAAAATGGAGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACTTCTTCCGCTACTTCCTGCGCCTGTCGGACGACAAAATGGAGCATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGAAGCTGATGAGGCTGCAGAACCTGCGCGGTGGCCACATCTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGAAGCTGATGAGGCTGCAGAACCTGCGCGGTGGCCACATCTGCCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACGATATCAGGAAGCCAGAGTGCCAAGGCTGGGAGAGCGGGCTCGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACGATATCAGGAAGCCAGAGTGCCAAGGCTGGGAGAGCGGGCTCGTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGGAGTCCGCCTTCCACCTGGAGAAGAACGTCAACCAGAGCCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGGAGTCCGCCTTCCACCTGGAGAAGAACGTCAACCAGAGCCTGCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCTGTACCAGCTGGCCGTGGAGAAGGGCGACCCCCAGCTGTGCCACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCTGTACCAGCTGGCCGTGGAGAAGGGCGACCCCCAGCTGTGCCACTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAGAGCCACTACCTGCACGAGCAAGTCAAGACCATCAAAGAGCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGAGAGCCACTACCTGCACGAGCAAGTCAAGACCATCAAAGAGCTGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCTACGTGAGCAACCTGCGCAAGATTTGTTCCCCGGAAGCCGGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCTACGTGAGCAACCTGCGCAAGATTTGTTCCCCGGAAGCCGGCCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    501 TGAGTACCTGTTCGACAAGCTCACCCTGGGCGGCCGCGTCAAAGAGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGAGTACCTGTTCGACAAGCTCACCCTGGGCGGCCGCGTCAAAGAGACT