seq1 = pF1KE6273.tfa, 576 bp
seq2 = pF1KE6273/gi568815596f_233837312.tfa (gi568815596f:233837312_234042775), 205464 bp

>pF1KE6273 576
>gi568815596f:233837312_234042775 (Chr2)

1-198  (100001-100198)   100% ->
199-376  (101687-101864)   100% ->
377-576  (105265-105464)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAATCCTTCCTTCCTGTCCACACCATCGTGCTTATCAGGGAGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAATCCTTCCTTCCTGTCCACACCATCGTGCTTATCAGGGAGAATGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCAAGTGTGGCTATGCCCAGAGCCAGCACATGGAAGGCACCCAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCAAGTGTGGCTATGCCCAGAGCCAGCACATGGAAGGCACCCAGATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCAAAGTGAGAAATGGAACTACAAGAAACACACCAAGGAATTTCCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCAAAGTGAGAAATGGAACTACAAGAAACACACCAAGGAATTTCCTACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGCCTTTGGGGATATTCAGTTTGAGACACTGGGGAAGAAAGGGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100151 GACGCCTTTGGGGATATTCAGTTTGAGACACTGGGGAAGAAAGGGAAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199        TATATACGTCTGTCCTGCGACACGGACGCGGAAATCCTTTACG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 A...TAGTATATACGTCTGTCCTGCGACACGGACGCGGAAATCCTTTACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCTGCTGACCCAGCACTGGCACCTGAAAACACCCAACCTGGTCATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101730 AGCTGCTGACCCAGCACTGGCACCTGAAAACACCCAACCTGGTCATTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGACCGGGGGCGCCAAGAACTTCGCCCTGAAGCCGCGCATGCGCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101780 GTGACCGGGGGCGCCAAGAACTTCGCCCTGAAGCCGCGCATGCGCAAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTTCAGCCGGCTCATCTACATCGCGCAGTCCAAAG         GTGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101830 CTTCAGCCGGCTCATCTACATCGCGCAGTCCAAAGGTG...CAGGTGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGATTCTCACGGGAGGCACCCATTATGGCCTGATGAAGTACATCGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105271 GGATTCTCACGGGAGGCACCCATTATGGCCTGATGAAGTACATCGGGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTGGTGAGAGATAACACCATCAGCAGGAGTTCAGAGGAGAATATTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105321 GTGGTGAGAGATAACACCATCAGCAGGAGTTCAGAGGAGAATATTGTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATTGGCATAGCAGCTTGGGGCATGGTCTCCAACCGGGACACCCTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105371 CATTGGCATAGCAGCTTGGGGCATGGTCTCCAACCGGGACACCCTCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGAATTGCGATGCTGAGGTACCGGTGGGACAGGAGGAGGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105421 GGAATTGCGATGCTGAGGTACCGGTGGGACAGGAGGAGGTCTGC