seq1 = pF1KE6271.tfa, 546 bp
seq2 = pF1KE6271/gi568815590f_39484623.tfa (gi568815590f:39484623_39710730), 226108 bp

>pF1KE6271 546
>gi568815590f:39484623_39710730 (Chr8)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-132  (100654-100730)   100% ->
133-188  (121685-121740)   100% ->
189-267  (124420-124498)   100% ->
268-344  (124863-124939)   100% ->
345-546  (125907-126108)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCCTTCTCCTCGCCCTCCTCACTGAGCTTGGAAGACTGCAAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCCTTCTCCTCGCCCTCCTCACTGAGCTTGGAAGACTGCAAGCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAAG         GTTCTGAAGGAATATTTCTGCATGTCACAGTTCCAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAAGGTA...CAGGTTCTGAAGGAATATTTCTGCATGTCACAGTTCCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAAGATTAAGTCAAATGACAGTGAAGTTTCAGAGAGGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100690 GGAAGATTAAGTCAAATGACAGTGAAGTTTCAGAGAGGAAGGTA...TAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATGATTTACATCATTACAATTGATGGACAACCTTACACTCTACATCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121685 ATGATTTACATCATTACAATTGATGGACAACCTTACACTCTACATCTCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAAACA         ATCATTCTTACCCCAGAACTTTTTGGTTTATACAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121735 AAAACAGTA...TAGATCATTCTTACCCCAGAACTTTTTGGTTTATACAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATAATGAAACTGGATCTTTGCATTCTGTGTCTCCATATTTTATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 124455 ATAATGAAACTGGATCTTTGCATTCTGTGTCTCCATATTTTATGGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    268    ATGCATTGCCATTACCAAGGATATGCTGCCGAATTTCCAAATTCATT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124860 CAGATGCATTGCCATTACCAAGGATATGCTGCCGAATTTCCAAATTCATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TGTGACACTCAGTATATGTTCTGGTCTCAG         GGGATTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 124910 TGTGACACTCAGTATATGTTCTGGTCTCAGGTA...CAGGGGATTTCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 AGTTTGAAAATATCAGTTATGGAATTGAACCAGTAGAATCTTCAGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125918 AGTTTGAAAATATCAGTTATGGAATTGAACCAGTAGAATCTTCAGCAAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TTTGAGCATATAATTTATCAAATGAAAAATAATGATCCAAATGTATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125968 TTTGAGCATATAATTTATCAAATGAAAAATAATGATCCAAATGTATCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TTTAGCAGTAAATTACAGTCATATTTGGCAGAAAGACCAGCCCTACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126018 TTTAGCAGTAAATTACAGTCATATTTGGCAGAAAGACCAGCCCTACAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTCCTTTAAACTCACAGGTGACTGTCATCATTCTGATGTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126068 TTCCTTTAAACTCACAGGTGACTGTCATCATTCTGATGTTA