seq1 = pF1KE6270.tfa, 576 bp
seq2 = pF1KE6270/gi568815580f_59039949.tfa (gi568815580f:59039949_59258682), 218734 bp

>pF1KE6270 576
>gi568815580f:59039949_59258682 (Chr18)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-197  (109565-109674)   100% ->
198-347  (112588-112737)   100% ->
348-467  (115740-115859)   100% ->
468-525  (117660-117717)   100% ->
526-576  (118684-118734)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGCGTGCGGGCGCCGTGGGGGCTCATCTCCCCGCGTCCGGCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGCGTGCGGGCGCCGTGGGGGCTCATCTCCCCGCGTCCGGCTTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATCTTCGGGGACCTGAAGAAGATGAACAAGCGCCAG         CTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 TATCTTCGGGGACCTGAAGAAGATGAACAAGCGCCAGGTG...CAGCTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTACCAGGTTTTAAACTTCGCCATGATCGTGTCTTCTGCACTCATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109569 ATTACCAGGTTTTAAACTTCGCCATGATCGTGTCTTCTGCACTCATGATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGAAAGGCTTGATCGTGCTCACAGGCAGTGAGAGCCCCATCGTGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109619 TGGAAAGGCTTGATCGTGCTCACAGGCAGTGAGAGCCCCATCGTGGTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGAG         TGGCAGTATGGAGCCGGCCTTTCACAGAGGAGACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109669 GCTGAGGTA...CAGTGGCAGTATGGAGCCGGCCTTTCACAGAGGAGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCTGTTCCTCACAAATTTCCGGGAAGACCCAATCAGAGCTGGTGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112623 TCCTGTTCCTCACAAATTTCCGGGAAGACCCAATCAGAGCTGGTGAAATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTGTTTTTAAAGTTGAAGGACGAGACATTCCAATAGTTCACAGAGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112673 GTTGTTTTTAAAGTTGAAGGACGAGACATTCCAATAGTTCACAGAGTAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAAGTTCATGAAAA         AGATAATGGAGACATCAAATTTCTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 112723 CAAAGTTCATGAAAAGTA...CAGAGATAATGGAGACATCAAATTTCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTAAAGGAGATAATAATGAAGTTGATGATAGAGGCTTGTACAAAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115766 CTAAAGGAGATAATAATGAAGTTGATGATAGAGGCTTGTACAAAGAAGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGAACTGGCTGGAAAAGAAGGACGTGGTGGGAAGAGCAAGAGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 115816 CAGAACTGGCTGGAAAAGAAGGACGTGGTGGGAAGAGCAAGAGGGTG...

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    468    GTTTTTACCATATGTTGGTATGGTCACCATAATAATGAATGACTATC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117657 TAGGTTTTTACCATATGTTGGTATGGTCACCATAATAATGAATGACTATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAAAATTCAAG         TATGCTCTTTTGGCTGTAATGGGTGCATAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 117707 CAAAATTCAAGGTA...CAGTATGCTCTTTTGGCTGTAATGGGTGCATAT

    600     .    :    .    :
    556 GTGTTACTAAAACGTGAATCC
        |||||||||||||||||||||
 118714 GTGTTACTAAAACGTGAATCC