seq1 = pF1KE6264.tfa, 921 bp
seq2 = pF1KE6264/gi568815584f_69299370.tfa (gi568815584f:69299370_69558590), 259221 bp

>pF1KE6264 921
>gi568815584f:69299370_69558590 (Chr14)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-205  (124725-124833)   100% ->
206-403  (142700-142897)   100% ->
404-472  (153872-153940)   100% ->
473-558  (155443-155528)   100% ->
559-693  (156363-156497)   100% ->
694-921  (158994-159221)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGATTTCATCTCCATTAGCCTGCTGTCTCTGGCTATGTTGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGATTTCATCTCCATTAGCCTGCTGTCTCTGGCTATGTTGGTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGTTACGTGGCCGGAATCATTCCCTTGGCTGTTAATTTCTCAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 ATGTTACGTGGCCGGAATCATTCCCTTGGCTGTTAATTTCTCAGAGGTA.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      GAACGACTGAAGCTGGTGACTGTTTTGGGTGCTGGCCTTCTCTGT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGGAACGACTGAAGCTGGTGACTGTTTTGGGTGCTGGCCTTCTCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAACTGCTCTGGCAGTCATCGTGCCTGAAGGAGTACATGCCCTTTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124770 GGAACTGCTCTGGCAGTCATCGTGCCTGAAGGAGTACATGCCCTTTATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATATTCTTGAGG         GAAAACACCACCAAGCAAGTGAAACAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 124820 AGATATTCTTGAGGGTG...TAGGAAAACACCACCAAGCAAGTGAAACAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATAATGTGATTGCATCAGACAAAGCAGCAGAAAAATCAGTTGTCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142727 ATAATGTGATTGCATCAGACAAAGCAGCAGAAAAATCAGTTGTCCATGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CATGAGCACAGCCACGACCACACACAGCTGCATGCCTATATTGGTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142777 CATGAGCACAGCCACGACCACACACAGCTGCATGCCTATATTGGTGTTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCGTTCTGGGCTTCGTTTTCATGTTGCTGGTGGACCAGATTGGTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142827 CCTCGTTCTGGGCTTCGTTTTCATGTTGCTGGTGGACCAGATTGGTAACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCATGTGCATTCTACTGACG         ATCCAGAAGCAGCAAGGTCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 142877 CCCATGTGCATTCTACTGACGGTG...TAGATCCAGAAGCAGCAAGGTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGCAATTCCAAAATCACCACCACGCTGGGTCTGGTTGTCCATGCTGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 153892 AGCAATTCCAAAATCACCACCACGCTGGGTCTGGTTGTCCATGCTGCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    473         CTGATGGTGTTGCTTTGGGAGCAGCAGCATCTACTTCACAGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153942 TA...TAGCTGATGGTGTTGCTTTGGGAGCAGCAGCATCTACTTCACAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCAGTGTCCAGTTAATTGTGTTTGTGGCAATCATGCTACATAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 155485 CCAGTGTCCAGTTAATTGTGTTTGTGGCAATCATGCTACATAAGGTA...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    559    GCACCAGCTGCTTTTGGACTGGTTTCCTTCTTGATGCATGCTGGCTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156360 CAGGCACCAGCTGCTTTTGGACTGGTTTCCTTCTTGATGCATGCTGGCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGAGCGGAATCGAATCAGAAAGCACTTGCTGGTCTTTGCATTGGCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156410 AGAGCGGAATCGAATCAGAAAGCACTTGCTGGTCTTTGCATTGGCAGCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CAGTTATGTCCATGGTGACATACTTAGGACTGAGTAAG         AGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 156460 CAGTTATGTCCATGGTGACATACTTAGGACTGAGTAAGGTA...CAGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGTAAAGAAGCCCTTTCAGAGGTGAACGCCACGGGAGTGGCCATGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158997 AGTAAAGAAGCCCTTTCAGAGGTGAACGCCACGGGAGTGGCCATGCTTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTCTGCCGGGACATTTCTTTATGTTGCCACAGTACATGTCCTCCCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159047 CTCTGCCGGGACATTTCTTTATGTTGCCACAGTACATGTCCTCCCTGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGGCGGAATAGGGCACAGCCACAAGCCCGATGCCACGGGAGGGAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159097 TGGGCGGAATAGGGCACAGCCACAAGCCCGATGCCACGGGAGGGAGAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTCAGCTGCCTGGAAGTGGCAGCCCTGGTTCTGGGTTGCCTCATCCCTCT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159147 CTCAGCCGCCTGGAAGTGGCAGCCCTGGTTCTGGGTTGCCTCATCCCTCT

    950     .    :    .    :    .
    897 CATCCTGTCAGTAGGACACCAGCAT
        |||||||||||||||||||||||||
 159197 CATCCTGTCAGTAGGACACCAGCAT