seq1 = pF1KE6261.tfa, 741 bp
seq2 = pF1KE6261/gi568815584r_67238624.tfa (gi568815584r:67238624_67459698), 221075 bp

>pF1KE6261 741
>gi568815584r:67238624_67459698 (Chr14)

(complement)

1-41  (100001-100041)   100% ->
42-159  (106659-106776)   100% ->
160-239  (109009-109088)   98% ->
240-307  (110595-110662)   100% ->
308-352  (112246-112290)   100% ->
353-456  (113828-113931)   100% ->
457-523  (116261-116327)   100% ->
524-602  (119181-119259)   100% ->
603-741  (120937-121075)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGGCAAAGACCGAATTGAAATCTTTCCCTCGCGAAT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100001 ATGTCGGGCAAAGACCGAATTGAAATCTTTCCCTCGCGAATGTA...TAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGCACAGACCATCATGAAGGCTCGTTTAAAGGGAGCACAGACAGGTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106659 GGCACAGACCATCATGAAGGCTCGTTTAAAGGGAGCACAGACAGGTCGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCTCCTGAAGAAAAAATCTGATGCCTTAACTCTTCGATTTCGACAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106709 ACCTCCTGAAGAAAAAATCTGATGCCTTAACTCTTCGATTTCGACAGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTAAAGAAGATAATAGAG         ACTAAAATGTTGATGGGCGAAGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 106759 CTAAAGAAGATAATAGAGGTA...CAGACTAAAATGTTGATGGGCGAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATGAGAGAAGCTGCCTTTTCACTAGCTGAAGCCATGTTCACAGCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 109032 GATGAGAGAAGCTGCCTTTTCACTAGCTGAAGCCAAGTTCACAGCAGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTTCAG         CACTACAGTTATCCAAAATGTCAATAAAGCGCAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109082 ACTTCAGGTA...CAGCACTACAGTTATCCAAAATGTCAATAAAGCGCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTGAAGATTCGAGCGAAGAAAGATAATGTAGCAG         GTGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 110629 GTGAAGATTCGAGCGAAGAAAGATAATGTAGCAGGTA...CAGGTGTTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TTTGCCAGTATTTGAACATTACCATGAAGGAACTGACA         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 112253 TTTGCCAGTATTTGAACATTACCATGAAGGAACTGACAGTA...CAGGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 ATGAACTGACTGGTTTAGCCAGAGGTGGGGAACAGTTGGCTAAATTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113831 ATGAACTGACTGGTTTAGCCAGAGGTGGGGAACAGTTGGCTAAATTAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 AGGAATTATGCCAAAGCAGTGGAACTACTGGTGGAACTAGCTTCTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113881 AGGAATTATGCCAAAGCAGTGGAACTACTGGTGGAACTAGCTTCTCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 G         ACTTCTTTTGTTACTTTGGATGAAGCTATTAAGATAACCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113931 GGTA...TAGACTTCTTTTGTTACTTTGGATGAAGCTATTAAGATAACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 ACAGGCGTGTAAATGCCATTGAACATG         TCATCATTCCCCGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 116301 ACAGGCGTGTAAATGCCATTGAACATGGTG...TAGTCATCATTCCCCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 ATTGAACGTACTCTTGCTTATATCATCACAGAGCTGGATGAGAGAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119195 ATTGAACGTACTCTTGCTTATATCATCACAGAGCTGGATGAGAGAGAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 AGAAGAGTTCTATAG         GTTAAAGAAAATACAAGAGAAGAAAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 119245 AGAAGAGTTCTATAGGTT...CAGGTTAAAGAAAATACAAGAGAAGAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 AGATTCTAAAGGAAAAATCTGAGAAGGACTTGGAGCAAAGGAGAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120963 AGATTCTAAAGGAAAAATCTGAGAAGGACTTGGAGCAAAGGAGAGCAGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GGAGAGGTGTTGGAGCCTGCTAATCTTCTGGCTGAAGAGAAGGACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121013 GGAGAGGTGTTGGAGCCTGCTAATCTTCTGGCTGAAGAGAAGGACGAGGA

    800     .    :
    729 TCTTCTATTTGAA
        |||||||||||||
 121063 TCTTCTATTTGAA