seq1 = pF1KE6260.tfa, 552 bp
seq2 = pF1KE6260/gi568815590f_143113268.tfa (gi568815590f:143113268_143315515), 202248 bp

>pF1KE6260 552
>gi568815590f:143113268_143315515 (Chr8)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-181  (100555-100683)   100% ->
182-295  (101746-101859)   100% ->
296-552  (101992-102248)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGCGCTCGGGGCTGTCCTGCTTGCCCTCTTGCTGTTCGGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGCGCTCGGGGCTGTCCTGCTTGCCCTCTTGCTGTTCGGGCGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AG         GGAGAGGGCAGACACAGCAGGAGGAAGAGGAAGAGGACG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGTG...CAGGGAGAGGGCAGACACAGCAGGAGGAAGAGGAAGAGGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGACCACGGGCCAGATGACTACGACGAGGAAGATGAGGATGAGGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100594 AGGACCACGGGCCAGATGACTACGACGAGGAAGATGAGGATGAGGTGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGAGGAGACCAACAGGCTCCCTGGTGGCAGGAGCAGAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100644 GAGGAGGAGACCAACAGGCTCCCTGGTGGCAGGAGCAGAGGTA...CAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTGCTGCGGTGCTACACCTGCAAGTCCCTGCCCAGGGACGAGCGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101747 GCTGCTGCGGTGCTACACCTGCAAGTCCCTGCCCAGGGACGAGCGCTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCTGACGCAGAACTGCTCACATGGCCAGACCTGCACAACCCTCATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101797 ACCTGACGCAGAACTGCTCACATGGCCAGACCTGCACAACCCTCATTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CACGGGAACACCG         AGTCAGGCCTCCTGACCACCCACTCCAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101847 CACGGGAACACCGGTA...CAGAGTCAGGCCTCCTGACCACCCACTCCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTGGTGCACAGACAGCTGCCAGCCCATCACCAAGACGGTGGAGGGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102020 GTGGTGCACAGACAGCTGCCAGCCCATCACCAAGACGGTGGAGGGGACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGTGACCATGACCTGCTGCCAGTCCAGCCTGTGCAATGTCCCACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102070 AGGTGACCATGACCTGCTGCCAGTCCAGCCTGTGCAATGTCCCACCCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAAAGCTCCCGAGTCCAGGACCCAACAGGCAAGGGGGCAGGCGGCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102120 CAAAGCTCCCGAGTCCAGGACCCAACAGGCAAGGGGGCAGGCGGCCCCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGGCAGCTCCGAAACTGTGGGCGCAGCCCTCCTGCTCAACCTCCTTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102170 GGGCAGCTCCGAAACTGTGGGCGCAGCCCTCCTGCTCAACCTCCTTGCCG

    550     .    :    .    :    .
    524 GCCTTGGAGCAATGGGGGCCAGGAGACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 102220 GCCTTGGAGCAATGGGGGCCAGGAGACCC