seq1 = pF1KE6258.tfa, 750 bp
seq2 = pF1KE6258/gi568815579r_50922548.tfa (gi568815579r:50922548_51125631), 203084 bp

>pF1KE6258 750
>gi568815579r:50922548_51125631 (Chr19)

(complement)

1-40  (100001-100040)   100% ->
41-197  (100838-100994)   100% ->
198-463  (101322-101587)   100% ->
464-600  (102404-102540)   100% ->
601-750  (102935-103084)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGATTCTGCAGTTAATCCTGCTTGCTCTGGCAACAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100001 ATGAGGATTCTGCAGTTAATCCTGCTTGCTCTGGCAACAGGTA...CAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCTTGTAGGGGGAGAGACCAGGATCATCAAGGGGTTCGAGTGCAAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100839 GCTTGTAGGGGGAGAGACCAGGATCATCAAGGGGTTCGAGTGCAAGCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTCCCAGCCCTGGCAGGCAGCCCTGTTCGAGAAGACGCGGCTACTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100889 ACTCCCAGCCCTGGCAGGCAGCCCTGTTCGAGAAGACGCGGCTACTCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGGCGACGCTCATCGCCCCCAGATGGCTCCTGACAGCAGCCCACTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100939 GGGGCGACGCTCATCGCCCCCAGATGGCTCCTGACAGCAGCCCACTGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGCC         CCGCTACATAGTTCACCTGGGGCAGCACAACCTCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100989 CAAGCCGTG...CAGCCGCTACATAGTTCACCTGGGGCAGCACAACCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAGGAGGAGGGCTGTGAGCAGACCCGGACAGCCACTGAGTCCTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101357 AGAAGGAGGAGGGCTGTGAGCAGACCCGGACAGCCACTGAGTCCTTCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CACCCCGGCTTCAACAACAGCCTCCCCAACAAAGACCACCGCAATGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101407 CACCCCGGCTTCAACAACAGCCTCCCCAACAAAGACCACCGCAATGACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATGCTGGTGAAGATGGCATCGCCAGTCTCCATCACCTGGGCTGTGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101457 CATGCTGGTGAAGATGGCATCGCCAGTCTCCATCACCTGGGCTGTGCGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCTCACCCTCTCCTCACGCTGTGTCACTGCTGGCACCAGCTGCCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101507 CCCTCACCCTCTCCTCACGCTGTGTCACTGCTGGCACCAGCTGCCTCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCCGGCTGGGGCAGCACGTCCAGCCCCCAGT         TACGCCTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101557 TCCGGCTGGGGCAGCACGTCCAGCCCCCAGTGTA...CAGTACGCCTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCACACCTTGCGATGCGCCAACATCACCATCATTGAGCACCAGAAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102414 TCACACCTTGCGATGCGCCAACATCACCATCATTGAGCACCAGAAGTGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAACGCCTACCCCGGCAACATCACAGACACCATGGTGTGTGCCAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102464 AGAACGCCTACCCCGGCAACATCACAGACACCATGGTGTGTGCCAGCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAGGAAGGGGGCAAGGACTCCTGCCAG         GGTGACTCCGGGGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102514 CAGGAAGGGGGCAAGGACTCCTGCCAGGTC...CAGGGTGACTCCGGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCTCTGGTCTGTAACCAGTCTCTTCAAGGCATTATCTCCTGGGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102949 CCCTCTGGTCTGTAACCAGTCTCTTCAAGGCATTATCTCCTGGGGCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATCCGTGTGCGATCACCCGAAAGCCTGGTGTCTACACGAAAGTCTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102999 ATCCGTGTGCGATCACCCGAAAGCCTGGTGTCTACACGAAAGTCTGCAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .
    715 TATGTGGACTGGATCCAGGAGACGATGAAGAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103049 TATGTGGACTGGATCCAGGAGACGATGAAGAACAAT