seq1 = pF1KE6255.tfa, 678 bp
seq2 = pF1KE6255/gi568815596r_46412034.tfa (gi568815596r:46412034_46612711), 200678 bp

>pF1KE6255 678
>gi568815596r:46412034_46612711 (Chr2)

(complement)

1-678  (100001-100678)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCTGCGTGATGTCGATGTGAAAAAGCAGATTAAGCACATGATGGC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCTGAGTGATGTCGATGTGAAAAAGCAGATTAAGCACATGATGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTCATTGAGCAGGAAGCCAATGAGAAAGCAGAGGAAATCGATGCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTCATTGAGCAGGAAGCCAATGAGAAAGCAGAGGAAATCGATGCCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAGGAAGAGTTTAACATTGAGAAAGGACGCCTCGTGCAAACCCAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAGGAAGAGTTTAACATTGAGAAAGGACGCCTCGTGCAAACCCAACGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGAAGATTATGGAGTATTATGAGAAAAAGGAGAAGCAGATAGAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGAAGATTATGGAGTATTATGAGAAAAAGGAGAAGCAGATAGAGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGAAAATCCTGATGTCCACCATGAGGAATCAGGCGAGGCTGAAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGAAAATCCTGATGTCCACCATGAGGAATCAGGCGAGGCTGAAAGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAGAGCCCGAAATGACCTCATCTCAGATTTGCTCAGTGAGGCGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGAGAGCCCGAAATGACCTCATCTCAGATTTGCTCAGTGAGGCGAAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGACTCAGCAGGATTGTGGAGGACCCAGAGGTCTACCAGGGGCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGACTCAGCAGGATTGTGGAGGACCCAGAGGTCTACCAGGGGCTGCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAAACTGGTGCTCCAGGGTCTGCTCCGACTGCTGGAACCTGTGATGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAAACTGGTGCTCCAGGGTCTGCTCCGACTGCTGGAACCTGTGATGATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TACGCTGCCGGCCACAAGACCTCCTCCTGGTGGAGGCTGCTGTACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TACGCTGCCGGCCACAAGACCTCCTCCTGGTGGAGGCTGCTGTACAAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCATCCCCGAGTACATGACAATTTCCCAGAAACATGTGGAGGTCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCATCCCCGAGTACATGACAATTTCCCAGAAACATGTGGAGGTCCAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGATAAAGAGGCATACCTGGCTGTGAATGCAGCTGGAGGTGTGGAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGATAAAGAGGCATACCTGGCTGTGAATGCAGCTGGAGGTGTGGAGGTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACAGTGGCAATCAGAGAATAAAGGTTTCAAATACCTTGGAAAGCCGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACAGTGGCAATCAGAGAATAAAGGTTTCAAATACCTTGGAAAGCCGACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATCTCTCAGCCAAGCAAAAGATGCCAGAAATACGAATGGCCTTGTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GATCTCTCAGCCAAGCAAAAGATGCCAGAAATACGAATGGCCTTGTTTGG

    650     .    :    .    :    .
    651 TGCTAACACCAACAGAAAGTTCTTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGCTAACACCAACAGAAAGTTCTTTATA