seq1 = pF1KE6249.tfa, 783 bp
seq2 = pF1KE6249/gi568815590r_85228563.tfa (gi568815590r:85228563_85441635), 213073 bp

>pF1KE6249 783
>gi568815590r:85228563_85441635 (Chr8)

(complement)

1-37  (100001-100037)   100% ->
38-235  (103187-103384)   100% ->
236-354  (104573-104691)   100% ->
355-450  (108016-108111)   100% ->
451-513  (109084-109146)   100% ->
514-669  (111792-111947)   100% ->
670-783  (112960-113073)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAGTCCAGACTGGGGATATGATGACAAAAATG         GTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100001 ATGGCAAGTCCAGACTGGGGATATGATGACAAAAATGGTA...TAGGTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGAACAATGGAGCAAGCTGTATCCCATTGCCAATGGAAATAACCAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103191 TGAACAATGGAGCAAGCTGTATCCCATTGCCAATGGAAATAACCAGTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGTTGATATTAAAACCAGTGAAACCAAACATGACACCTCTCTGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103241 CTGTTGATATTAAAACCAGTGAAACCAAACATGACACCTCTCTGAAACCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTAGTGTCTCCTACAACCCAGCCACAGCCAAAGAAATTATCAATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103291 ATTAGTGTCTCCTACAACCCAGCCACAGCCAAAGAAATTATCAATGTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCATTCCTTCCATGTAAATTTTGAGGACAACGATAACCGATCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103341 GCATTCCTTCCATGTAAATTTTGAGGACAACGATAACCGATCAGGTG...

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    236    TGCTGAAAGGTGGTCCTTTCTCTGACAGCTACAGGCTCTTTCAGTTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104570 CAGTGCTGAAAGGTGGTCCTTTCTCTGACAGCTACAGGCTCTTTCAGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CATTTTCACTGGGGCAGTACAAATGAGCATGGTTCAGAACATACAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104620 CATTTTCACTGGGGCAGTACAAATGAGCATGGTTCAGAACATACAGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGAGTCAAATATTCTGCCGAG         CTTCACGTAGCTCACTGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 104670 TGGAGTCAAATATTCTGCCGAGGTA...TAGCTTCACGTAGCTCACTGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATTCTGCAAAGTACTCCAGCCTTGCTGAAGCTGCCTCAAAGGCTGATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108035 ATTCTGCAAAGTACTCCAGCCTTGCTGAAGCTGCCTCAAAGGCTGATGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTGGCAGTTATTGGTGTTTTGATGAAG         GTTGGTGAGGCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108085 TTGGCAGTTATTGGTGTTTTGATGAAGGTG...CAGGTTGGTGAGGCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCCAAAGCTGCAGAAAGTACTTGATGCCCTCCAAGCAATTAAAACCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 109098 CCCAAAGCTGCAGAAAGTACTTGATGCCCTCCAAGCAATTAAAACCAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    514         GGCAAACGAGCCCCATTCACAAATTTTGACCCCTCTACTCTC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109148 TA...CAGGGCAAACGAGCCCCATTCACAAATTTTGACCCCTCTACTCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTTCCTTCATCCCTGGATTTCTGGACCTACCCTGGCTCTCTGACTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111834 CTTCCTTCATCCCTGGATTTCTGGACCTACCCTGGCTCTCTGACTCATCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCCTCTTTATGAGAGTGTAACTTGGATCATCTGTAAGGAGAGCATCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111884 TCCTCTTTATGAGAGTGTAACTTGGATCATCTGTAAGGAGAGCATCAGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCAGCTCAGAGCAG         CTGGCACAATTCCGCAGCCTTCTATCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 111934 TCAGCTCAGAGCAGGTA...TAGCTGGCACAATTCCGCAGCCTTCTATCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AATGTTGAAGGTGATAACGCTGTCCCCATGCAGCACAACAACCGCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112987 AATGTTGAAGGTGATAACGCTGTCCCCATGCAGCACAACAACCGCCCAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .
    747 CCAACCTCTGAAGGGCAGAACAGTGAGAGCTTCATTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113037 CCAACCTCTGAAGGGCAGAACAGTGAGAGCTTCATTT