seq1 = pF1KE6240.tfa, 585 bp
seq2 = pF1KE6240/gi568815575f_119136364.tfa (gi568815575f:119136364_119343251), 206888 bp

>pF1KE6240 585
>gi568815575f:119136364_119343251 (ChrX)

1-328  (100001-100328)   100% ->
329-484  (103946-104101)   100% ->
485-585  (106788-106888)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCCGAGGATGTGGTGGCGACTGGCGCCGACCCAAGCGATCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCCGAGGATGTGGTGGCGACTGGCGCCGACCCAAGCGATCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCGGCGGGCTGCTGCATGAGATTTTCACGTCGCCGCTCAACCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCGGCGGGCTGCTGCATGAGATTTTCACGTCGCCGCTCAACCTGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTTGGCCTCTGCATCTTCCTGCTCTACAAGATCGTGCGCGGGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTTGGCCTCTGCATCTTCCTGCTCTACAAGATCGTGCGCGGGGACCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGGCGGCCAGCGGCGACAGCGACGACGACGAGCCGCCCCCTCTGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGGCGGCCAGCGGCGACAGCGACGACGACGAGCCGCCCCCTCTGCCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCAAGCGGCGCGACTTCACCCCCGCCGAGCTGCGGCGCTTCGACGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCAAGCGGCGCGACTTCACCCCCGCCGAGCTGCGGCGCTTCGACGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCAGGACCCGCGCATACTCATGGCCATCAACGGCAAGGTGTTCGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCAGGACCCGCGCATACTCATGGCCATCAACGGCAAGGTGTTCGATGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCAAAGGCCGCAAATTCTACGGGCCCG         AGGGGCCGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100301 ACCAAAGGCCGCAAATTCTACGGGCCCGGTA...AAGAGGGGCCGTATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGTCTTTGCTGGAAGAGATGCATCCAGGGGCCTTGCCACATTTTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103959 GGTCTTTGCTGGAAGAGATGCATCCAGGGGCCTTGCCACATTTTGCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATAAGGAAGCACTGAAGGATGAGTACGATGACCTTTCTGACCTCACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104009 ATAAGGAAGCACTGAAGGATGAGTACGATGACCTTTCTGACCTCACTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCCAGCAGGAGACTCTGAGTGACTGGGAGTCTCAGTTCACTT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104059 GCCCAGCAGGAGACTCTGAGTGACTGGGAGTCTCAGTTCACTTGTA...C

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    485   TCAAGTATCATCACGTGGGCAAACTGCTGAAGGAGGGGGAGGAGCCCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106786 AGTCAAGTATCATCACGTGGGCAAACTGCTGAAGGAGGGGGAGGAGCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTGTGTACTCAGATGAGGAAGAACCAAAAGATGAGAGTGCCCGGAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106836 CTGTGTACTCAGATGAGGAAGAACCAAAAGATGAGAGTGCCCGGAAAAAT

    600 
    583 GAT
        |||
 106886 GAT