seq1 = pF1KE6239.tfa, 855 bp
seq2 = pF1KE6239/gi568815590r_38044276.tfa (gi568815590r:38044276_38250818), 206543 bp

>pF1KE6239 855
>gi568815590r:38044276_38250818 (Chr8)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-178  (102065-102178)   100% ->
179-306  (102492-102619)   100% ->
307-465  (104372-104530)   100% ->
466-650  (104672-104856)   100% ->
651-744  (105504-105597)   100% ->
745-855  (106433-106543)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCTAGCGACATTCAAGCTGTGCGCTGGGAGCTCCTACAGACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCTAGCGACATTCAAGCTGTGCGCTGGGAGCTCCTACAGACACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCAACATGAAGG         GGCTGAGGCAACAGGCTGTGATGGCCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCAACATGAAGGGTG...CAGGGCTGAGGCAACAGGCTGTGATGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAGCCAGGAGCTGAACCGGAGGGCCCTGGGGGGCCCCACCCCTAGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102092 TCAGCCAGGAGCTGAACCGGAGGGCCCTGGGGGGCCCCACCCCTAGCACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGATTAACCAGGTTCGGCGGCGGAGCTCTCTACTCG         GTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102142 TGGATTAACCAGGTTCGGCGGCGGAGCTCTCTACTCGGTA...CAGGTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCGGCTGGAAGAGACTCTCTACAGTGACCAGGAGCTGGCCTATCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102496 TCGGCTGGAAGAGACTCTCTACAGTGACCAGGAGCTGGCCTATCTCCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGGGGAGGAGGCCATGCAGAAGGCCTTGGGCATCCTTAGCAACCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102546 AGGGGGAGGAGGCCATGCAGAAGGCCTTGGGCATCCTTAGCAACCAAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCTGGAAGAAGGAGAGTCAGCAG         GACAATGGGGACAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 102596 GGCTGGAAGAAGGAGAGTCAGCAGGTA...CAGGACAATGGGGACAAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATGAGTAAAGTGGTCCCAGATGTGGGCAAGGTGTTCCGGCTGGAGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104389 GATGAGTAAAGTGGTCCCAGATGTGGGCAAGGTGTTCCGGCTGGAGGTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGTGGACCAGCCCATGGAGAGGCTCTATGAAGAGCTCGTGGAGCGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104439 TGGTGGACCAGCCCATGGAGAGGCTCTATGAAGAGCTCGTGGAGCGCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGCAATGGGGGAGTGGAACCCCAATGTCAAGGAGATCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104489 GAAGCAATGGGGGAGTGGAACCCCAATGTCAAGGAGATCAAGGTG...TA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    466  GTCCTGCAGAAGATCGGAAAAGATACATTCATTACTCACGAGCTGGCTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104671 GGTCCTGCAGAAGATCGGAAAAGATACATTCATTACTCACGAGCTGGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCGAGGCAGCAGGAAACCTGGTGGGGCCCCGTGACTTTGTGAGCGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104721 CCGAGGCAGCAGGAAACCTGGTGGGGCCCCGTGACTTTGTGAGCGTGCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGTGCCAAGCGCCGAGGCTCCACCTGTGTGCTGGCTGGCATGGCCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104771 TGTGCCAAGCGCCGAGGCTCCACCTGTGTGCTGGCTGGCATGGCCACAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTCGGGAACATGCCTGAGCAGAAGGGTGTCATCAG         GGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104821 CTTCGGGAACATGCCTGAGCAGAAGGGTGTCATCAGGTA...CAGGGCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCACGGTCCCACTTGCATGGTGCTTCACCCGTTGGCTGGAAGTCCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105509 AGCACGGTCCCACTTGCATGGTGCTTCACCCGTTGGCTGGAAGTCCCTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGACCAAACTTACGTGGCTACTCAGCATCGACCTCAAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 105559 AAGACCAAACTTACGTGGCTACTCAGCATCGACCTCAAGGTG...CAGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GTGGCTGCCCAAGAGCATCATCAACCAGGTCCTGTCCCAGACCCAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106435 GTGGCTGCCCAAGAGCATCATCAACCAGGTCCTGTCCCAGACCCAGGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ATTTTGCCAACCACCTGCGCAAGCGCCTGGAGTCCCACCCTGCCTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106485 ATTTTGCCAACCACCTGCGCAAGCGCCTGGAGTCCCACCCTGCCTCTGAA

    900     .
    847 GCCAGGTGT
        |||||||||
 106535 GCCAGGTGT