seq1 = pF1KE6233.tfa, 873 bp
seq2 = pF1KE6233/gi568815585r_113549377.tfa (gi568815585r:113549377_113758144), 208768 bp

>pF1KE6233 873
>gi568815585r:113549377_113758144 (Chr13)

(complement)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-241  (103203-103331)   100% ->
242-355  (104711-104824)   100% ->
356-555  (105073-105272)   100% ->
556-612  (106418-106474)   100% ->
613-714  (107638-107739)   100% ->
715-873  (108610-108768)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTCTGCAGGAGAAGAAGACGTGTGGCCAGCGCATGGAGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTCTGCAGGAGAAGAAGACGTGTGGCCAGCGCATGGAGGAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGCGTTACTGCTGGAACCCGGACACGGGGCAGATGCTGGGCCGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGCGTTACTGCTGGAACCCGGACACGGGGCAGATGCTGGGCCGCACCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTCCCGGTGGG         TGTGGATCAGCCTGTACTACGTGGCCTTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTCCCGGTGGGGTA...CAGTGTGGATCAGCCTGTACTACGTGGCCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACGTGGTGATGACTGGGCTCTTCGCCCTGTGCCTCTATGTGCTGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103232 TACGTGGTGATGACTGGGCTCTTCGCCCTGTGCCTCTATGTGCTGATGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACAGTGGACCCGTACACACCGGACTACCAAGACCAGCTACGGTCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103282 GACAGTGGACCCGTACACACCGGACTACCAAGACCAGCTACGGTCACCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242          GGGTAACCTTAAGGCCGGATGTTTACGGGGAGAAAGGCCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103332 GTA...CAGGGGTAACCTTAAGGCCGGATGTTTACGGGGAGAAAGGCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAATTGTCTACAACGTCTCTGATAACAGAACCTGGGCAGACCTCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104752 GAAATTGTCTACAACGTCTCTGATAACAGAACCTGGGCAGACCTCACACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GACTCTCCACGCCTTCCTAGCAG         GCTACTCTCCAGCAGCCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104802 GACTCTCCACGCCTTCCTAGCAGGTG...CAGGCTACTCTCCAGCAGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGAGGACAGCATCAACTGCACCTCCGAGCAGTACTTCTTCCAGGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105091 AGGAGGACAGCATCAACTGCACCTCCGAGCAGTACTTCTTCCAGGAGAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCCGCGCTCCCAACCACACCAAGTTCTCCTGCAAGTTCACGGCAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105141 TTCCGCGCTCCCAACCACACCAAGTTCTCCTGCAAGTTCACGGCAGATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTGCAGAACTGCTCAGGCCTGGCGGATCCCAACTTCGGCTTTGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105191 GCTGCAGAACTGCTCAGGCCTGGCGGATCCCAACTTCGGCTTTGAAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAAAGCCATGTTTTATTATTAAAATGAACAGG         ATCGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105241 GAAAGCCATGTTTTATTATTAAAATGAACAGGGTG...TAGATCGTCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTCCTCCCCAGCAACGGCTCGGCCCCCAGAGTGGACTGCGCCTTCCTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106427 TTCCTCCCCAGCAACGGCTCGGCCCCCAGAGTGGACTGCGCCTTCCTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    613        GACCAGCCCCGCGAGCTCGGCCAGCCGCTGCAGGTCAAGTACT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106477 G...CAGGACCAGCCCCGCGAGCTCGGCCAGCCGCTGCAGGTCAAGTACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACCCTCCCAACGGCACCTTCAGTCTGCACTACTTCCCTTATTACGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107681 ACCCTCCCAACGGCACCTTCAGTCTGCACTACTTCCCTTATTACGGGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAAGCCCAG         CCCCACTACAGCAACCCCCTGGTGGCAGCGAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 107731 AAAGCCCAGGTA...CAGCCCCACTACAGCAACCCCCTGGTGGCAGCGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCTCCTCAACATCCCCAGGAACGCTGAGGTCGCCATCGTGTGCAAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108642 GCTCCTCAACATCCCCAGGAACGCTGAGGTCGCCATCGTGTGCAAGGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGCAGAGCACGTGACCTTCAACAATCCCCACGACCCGTATGAAGGGAAA
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108692 TGGCGGAGCACGTGACCTTCAACAATCCCCACGACCCGTATGAAGGGAAA

    900     .    :    .    :    .
    847 GTGGAGTTCAAACTCAAGATTGAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||
 108742 GTGGAGTTCAAACTCAAGATTGAGAAG