seq1 = pF1KE6231.tfa, 744 bp
seq2 = pF1KE6231/gi568815587r_60072161.tfa (gi568815587r:60072161_60281727), 209567 bp

>pF1KE6231 744
>gi568815587r:60072161_60281727 (Chr11)

(complement)

1-147  (100001-100147)   100% ->
148-282  (101763-101897)   100% ->
283-339  (103412-103468)   98% ->
340-549  (106117-106326)   100% ->
550-651  (108599-108700)   98% ->
652-744  (109475-109567)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACATCACAACCTGTTCCCAATGAGACCATCATAGTGCTCCCATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACATCACAACCTGTTCCCAATGAGACCATCATAGTGCTCCCATCAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCATCAACTTCTCCCAAGCAGAGAAACCCGAACCCACCAACCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCATCAACTTCTCCCAAGCAGAGAAACCCGAACCCACCAACCAGGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGATAGCCTGAAGAAACATCTACACGCAGAAATCAAAGTTATTGGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100101 AGGATAGCCTGAAGAAACATCTACACGCAGAAATCAAAGTTATTGGGGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148       ACTATCCAGATCTTGTGTGGCATGATGGTATTGAGCTTGGGGAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ...CAGACTATCCAGATCTTGTGTGGCATGATGGTATTGAGCTTGGGGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATTTTGGCATCTGCTTCCTTCTCTCCAAATTTTACCCAAGTGACTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101807 CATTTTGGCATCTGCTTCCTTCTCTCCAAATTTTACCCAAGTGACTTCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CACTGTTGAACTCTGCTTACCCATTCATAGGACCCTTTTTT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101857 CACTGTTGAACTCTGCTTACCCATTCATAGGACCCTTTTTTGTG...TAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTATCATCTCTGGCTCTCTATCAATCGCCACAGAGAAAAGGTTGACCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 103412 TTTATCATCTCTGGCTCTCTATCAATCGCCACAGAGAAAAGGTTAACCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTTTTG         GTGCATAGCAGCCTGGTTGGAAGCATTCTGAGTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103462 GCTTTTGGTG...CAGGTGCATAGCAGCCTGGTTGGAAGCATTCTGAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTCTGTCTGCCCTGGTGGGTTTCATTATCCTGTCTGTCAAACAGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106151 CTCTGTCTGCCCTGGTGGGTTTCATTATCCTGTCTGTCAAACAGGCCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTAAATCCTGCCTCACTGCAGTGTGAGTTGGACAAAAATAATATACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106201 TTAAATCCTGCCTCACTGCAGTGTGAGTTGGACAAAAATAATATACCAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAGAAGTTATGTTTCTTACTTTTATCATGATTCACTTTATACCACGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106251 AAGAAGTTATGTTTCTTACTTTTATCATGATTCACTTTATACCACGGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTATACAGCCAAAGCCAGTCTGGCT         GGATCCCTCTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| | |||||||||
 106301 GCTATACAGCCAAAGCCAGTCTGGCTGTA...CAGGGAACTCTCTCTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGCTGATTTGCACTCTGCTGGAATTCTGCCTAGCTGTGCTCACTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108614 ATGCTGATTTGCACTCTGCTGGAATTCTGCCTAGCTGTGCTCACTGCTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTGCGGTGGAAACAGGCTTACTCTGACTTCCCTGGG         AGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 108664 GCTGCGGTGGAAACAGGCTTACTCTGACTTCCCTGGGGTG...TAGAGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TACTTTTCCTGCCTCACAGTTACATTGGTAATTCTGGCATGTCCTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109479 TACTTTTCCTGCCTCACAGTTACATTGGTAATTCTGGCATGTCCTCAAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .
    706 ATGACTCATGACTGTGGATATGAAGAACTATTGACTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109529 ATGACTCATGACTGTGGATATGAAGAACTATTGACTTCT