seq1 = pF1KE6214.tfa, 813 bp
seq2 = pF1KE6214/gi568815579f_10187013.tfa (gi568815579f:10187013_10388101), 201089 bp

>pF1KE6214 813
>gi568815579f:10187013_10388101 (Chr19)

1-394  (100001-100394)   100% ->
395-697  (100524-100826)   100% ->
698-813  (100974-101089)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTCTCTGTTCCCTCTGTCGCTGCTGTTTTTTTTGGCGGCCGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTCTCTGTTCCCTCTGTCGCTGCTGTTTTTTTTGGCGGCCGCCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGGGAGTTGGGAGCGCGCTGGGACGCCGGACTAAGCGGGCGCAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCGGGAGTTGGGAGCGCGCTGGGACGCCGGACTAAGCGGGCGCAAAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAGGGTAGCCCTCTCGCGCCCTCCGGGACCTCAGTGCCCTTCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAAGGGTAGCCCTCTCGCGCCCTCCGGGACCTCAGTGCCCTTCTGGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCATGAGCCCGGAGTTCGTGGCTGTGCAGCCGGGGAAGTCAGTGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCATGAGCCCGGAGTTCGTGGCTGTGCAGCCGGGGAAGTCAGTGCAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAATTGCAGCAACAGCTGTCCCCAGCCGCAGAATTCCAGCCTCCGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAATTGCAGCAACAGCTGTCCCCAGCCGCAGAATTCCAGCCTCCGCACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCTGCGGCAAGGCAAGACGCTCAGAGGGCCGGGTTGGGTGTCTTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCTGCGGCAAGGCAAGACGCTCAGAGGGCCGGGTTGGGTGTCTTACCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTCGACGTGAGGGCCTGGAGCTCCCTCGCGCACTGCCTCGTGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTCGACGTGAGGGCCTGGAGCTCCCTCGCGCACTGCCTCGTGACCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCAGGAAAAACACGCTGGGCCACCTCCAGGATCACCGCCTACA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100351 CGCAGGAAAAACACGCTGGGCCACCTCCAGGATCACCGCCTACAGTG...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    395    AACCGCCCCACAGCGTGATTTTGGAGCCTCCGGTCTTAAAGGGCAGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100521 TAGAACCGCCCCACAGCGTGATTTTGGAGCCTCCGGTCTTAAAGGGCAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAATACACTTTGCGCTGCCACGTGACGCAGGTGTTCCCGGTGGGCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100571 AAATACACTTTGCGCTGCCACGTGACGCAGGTGTTCCCGGTGGGCTACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGTGGTGACCCTGAGGCATGGAAGCCGGGTCATCTATTCCGAAAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100621 GGTGGTGACCCTGAGGCATGGAAGCCGGGTCATCTATTCCGAAAGCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGCGCTTCACCGGCCTGGATCTGGCCAACGTGACCTTGACCTACGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100671 AGCGCTTCACCGGCCTGGATCTGGCCAACGTGACCTTGACCTACGAGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCTGCTGGACCCCGCGACTTCTGGCAGCCCGTGATCTGCCACGCGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100721 GCTGCTGGACCCCGCGACTTCTGGCAGCCCGTGATCTGCCACGCGCGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAATCTCGACGGCCTGGTGGTCCGCAACAGCTCGGCACCCATTACACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100771 CAATCTCGACGGCCTGGTGGTCCGCAACAGCTCGGCACCCATTACACTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCTCG         CTTGGAGCCCCGCGCCCACAGCTTTGGCCTCCGGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100821 TGCTCGGTG...CAGCTTGGAGCCCCGCGCCCACAGCTTTGGCCTCCGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCCATCGCTGCCCTTGTAGGGATCCTCCTCACTGTGGGCGCTGCGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101009 TCCATCGCTGCCCTTGTAGGGATCCTCCTCACTGTGGGCGCTGCGTACCT

    800     .    :    .    :    .    :
    783 ATGCAAGTGCCTAGCTATGAAGTCCCAGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 101059 ATGCAAGTGCCTAGCTATGAAGTCCCAGGCG