seq1 = pF1KE6213.tfa, 603 bp
seq2 = pF1KE6213/gi568815591f_26260973.tfa (gi568815591f:26260973_26472569), 211597 bp

>pF1KE6213 603
>gi568815591f:26260973_26472569 (Chr7)

1-24  (85471-85494)   100% ->
25-111  (100003-100089)   100% ->
112-212  (103563-103663)   100% ->
213-311  (104075-104173)   100% ->
312-524  (110849-111061)   100% ->
525-603  (111519-111597)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTCCGGAACAACAGAAAGAG         GAATTTGTAAGTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  85471 ATGTTTCCGGAACAACAGAAAGAGGTA...CAGGAATTTGTAAGTGTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGTTCGAGATCCTAGGATTCAGAAGGAGGACTTCTGGCATTCTTACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100020 GGTTCGAGATCCTAGGATTCAGAAGGAGGACTTCTGGCATTCTTACATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTATGAGATATGTATTCAT         ACTAATAGCATGTGTTTTACA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100070 ACTATGAGATATGTATTCATGTA...CAGACTAATAGCATGTGTTTTACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATGAAAACATCCTGTGTACGAAGAAGATATAGAGAATTCGTGTGGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103584 ATGAAAACATCCTGTGTACGAAGAAGATATAGAGAATTCGTGTGGCTGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCAGAGACTCCAAAGTAATGCGTTGCTGGT         ACAACTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103634 GCAGAGACTCCAAAGTAATGCGTTGCTGGTGTA...AAGACAACTGCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AACTTCCATCTAAAAACCTGTTTTTCAACATGAACAATCGCCAGCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104086 AACTTCCATCTAAAAACCTGTTTTTCAACATGAACAATCGCCAGCACGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GATCAGCGTCGCCAGGGTCTGGAAGATTTCCTCAGAAA         AGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 104136 GATCAGCGTCGCCAGGGTCTGGAAGATTTCCTCAGAAAGTG...TAGAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CCTACAGAATGCACTTTTGCTTTCAGATAGCAGCCTTCACCTCTTCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110852 CCTACAGAATGCACTTTTGCTTTCAGATAGCAGCCTTCACCTCTTCTTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGAGCCATCTGAATTCAGAAGACATTGAGGCGTGTGTTTCTGGGCAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110902 AGAGCCATCTGAATTCAGAAGACATTGAGGCGTGTGTTTCTGGGCAGACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAGTACTCTGTGGAAGAAGCAATTCACAAGTTTGCCTTAATGAATAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110952 AAGTACTCTGTGGAAGAAGCAATTCACAAGTTTGCCTTAATGAATAGACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTCCCTGAAGAAGATGAAGAAGGAAAAAAAGAAAATGATATAGATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111002 TTTCCCTGAAGAAGATGAAGAAGGAAAAAAAGAAAATGATATAGATTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATTCAGAAAG         TTCATCCTCTGGGCTTGGACACAGTAGTGAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 111052 ATTCAGAAAGGTA...CAGTTCATCCTCTGGGCTTGGACACAGTAGTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    556 GACAGCAGTTCACATGGATGTAAAGTAAATACAGCTCCGCAGGAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111550 GACAGCAGTTCACATGGATGTAAAGTAAATACAGCTCCGCAGGAATCC