seq1 = pF1KE6209.tfa, 759 bp
seq2 = pF1KE6209/gi568815579r_50877539.tfa (gi568815579r:50877539_51082399), 204861 bp

>pF1KE6209 759
>gi568815579r:50877539_51082399 (Chr19)

(complement)

1-73  (100001-100073)   98% ->
74-221  (100486-100633)   100% ->
222-469  (101913-102160)   100% ->
470-606  (102476-102612)   100% ->
607-759  (104709-104861)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAGATCCCTTCTCCTGCCCCTGCAGATCCTACTGCTATCCTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100001 ATGGCAAGATCCCTTCTCCTGCCCCTGCAGATCTTACTGCTATCCTTAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGGAAACTGCAGGAGAAGAAG         CCCAGGGTGACAAGATTA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 CTTGGAAACTGCAGGAGAAGAAGGTG...CAGCCCAGGGTGACAAGATTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGATGGCGCCCCATGTGCAAGAGGCTCCCACCCATGGCAGGTGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100504 TTGATGGCGCCCCATGTGCAAGAGGCTCCCACCCATGGCAGGTGGCCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCAGTGGCAATCAGCTCCACTGCGGAGGCGTCCTGGTCAATGAGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100554 CTCAGTGGCAATCAGCTCCACTGCGGAGGCGTCCTGGTCAATGAGCGCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTGCTCACTGCCGCCCACTGCAAGATGAA         TGAGTACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100604 GGTGCTCACTGCCGCCCACTGCAAGATGAAGTA...CAGTGAGTACACCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCACCTGGGCAGTGATACGCTGGGCGACAGGAGAGCTCAGAGGATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101924 TGCACCTGGGCAGTGATACGCTGGGCGACAGGAGAGCTCAGAGGATCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCTCGAAGTCATTCCGCCACCCCGGCTACTCCACACAGACCCATGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101974 GCCTCGAAGTCATTCCGCCACCCCGGCTACTCCACACAGACCCATGTTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGACCTCATGCTCGTGAAGCTCAATAGCCAGGCCAGGCTGTCATCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102024 TGACCTCATGCTCGTGAAGCTCAATAGCCAGGCCAGGCTGTCATCCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGAAGAAAGTCAGGCTGCCCTCCCGCTGCGAACCCCCTGGAACCACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102074 TGAAGAAAGTCAGGCTGCCCTCCCGCTGCGAACCCCCTGGAACCACCTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACTGTCTCCGGCTGGGGCACTACCACGAGCCCAGATG         TGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102124 ACTGTCTCCGGCTGGGGCACTACCACGAGCCCAGATGGTA...CAGTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTTCCCTCTGACCTCATGTGCGTGGATGTCAAGCTCATCTCCCCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102480 CTTTCCCTCTGACCTCATGTGCGTGGATGTCAAGCTCATCTCCCCCCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACTGCACGAAGGTTTACAAGGACTTACTGGAAAATTCCATGCTGTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102530 ACTGCACGAAGGTTTACAAGGACTTACTGGAAAATTCCATGCTGTGCGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGCATCCCCGACTCCAAGAAAAACGCCTGCAAT         GGTGACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102580 GGCATCCCCGACTCCAAGAAAAACGCCTGCAATGTG...TAGGGTGACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGGGGGACCGTTGGTGTGCAGAGGTACCCTGCAAGGTCTGGTGTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104717 AGGGGGACCGTTGGTGTGCAGAGGTACCCTGCAAGGTCTGGTGTCCTGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GAACTTTCCCTTGCGGCCAACCCAATGACCCAGGAGTCTACACTCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104767 GAACTTTCCCTTGCGGCCAACCCAATGACCCAGGAGTCTACACTCAAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    715 TGCAAGTTCACCAAGTGGATAAATGACACCATGAAAAAGCATCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104817 TGCAAGTTCACCAAGTGGATAAATGACACCATGAAAAAGCATCGC