seq1 = pF1KE6208.tfa, 579 bp
seq2 = pF1KE6208/gi568815583r_89735518.tfa (gi568815583r:89735518_89993949), 258432 bp

>pF1KE6208 579
>gi568815583r:89735518_89993949 (Chr15)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-161  (104810-104901)   100% ->
162-273  (105318-105429)   100% ->
274-345  (122404-122475)   100% ->
346-453  (156228-156335)   100% ->
454-579  (158307-158432)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTCAGGCGATTCTGGTTTTCAACAACCATGGGAAGCCACGGCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTCAGGCGATTCTGGTTTTCAACAACCATGGGAAGCCACGGCTAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCTTCTACCAGCGTTTC         CCAGAAGAAATTCAACAGCAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCTTCTACCAGCGTTTCGTG...TAGCCAGAAGAAATTCAACAGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGTTCGAGAGACTTTCCATCTAGTCCTCAAGCGGGATGACAACATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104832 TTGTTCGAGAGACTTTCCATCTAGTCCTCAAGCGGGATGACAACATCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACTTCTTGGAGGGTGGAAG         TTTGATTGGTGGCTCTGACTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104882 AACTTCTTGGAGGGTGGAAGGTA...CAGTTTGATTGGTGGCTCTGACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAACTGATCTACCGGCACTATGCTACCCTCTACTTTGTATTTTGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105339 CAAACTGATCTACCGGCACTATGCTACCCTCTACTTTGTATTTTGTGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTCCTCAGAGAGTGAACTTGGAATCTTGGACCTCATCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105389 ATTCCTCAGAGAGTGAACTTGGAATCTTGGACCTCATCCAGGTA...TAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTTTTTGTGGAAACTCTGGATAAGTGTTTCGAAAATGTGTGTGAATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122404 GTTTTTGTGGAAACTCTGGATAAGTGTTTCGAAAATGTGTGTGAATTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTGATCTTCCATATGGATAAG         GTGCACTACATCCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 122454 TTTGATCTTCCATATGGATAAGGTA...TAGGTGCACTACATCCTCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGGTGGTGATGGGTGGGATGGTGTTGGAAACAAACATGAATGAAATCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156247 AGGTGGTGATGGGTGGGATGGTGTTGGAAACAAACATGAATGAAATCGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCTCAGATTGAGGCTCAAAACAGGCTGGAGAAATCCGAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 156297 GCTCAGATTGAGGCTCAAAACAGGCTGGAGAAATCCGAGGTG...TAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGGCCTTTCAGCAGCCCCTGCGCGGGCTGTGTCTGCTGTGAAAAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158309 TGGCCTTTCAGCAGCCCCTGCGCGGGCTGTGTCTGCTGTGAAAAACATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACCTGCCAGAGATTCCTCGGAACATCAACATTGGCGATCTCAACATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158359 ACCTGCCAGAGATTCCTCGGAACATCAACATTGGCGATCTCAACATCAAA

    600     .    :    .    :
    556 GTTCCCAACCTGTCCCAGTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||
 158409 GTTCCCAACCTGTCCCAGTTTGTC