seq1 = pF1KE6207.tfa, 828 bp
seq2 = pF1KE6207/gi568815579r_50914803.tfa (gi568815579r:50914803_51119130), 204328 bp

>pF1KE6207 828
>gi568815579r:50914803_51119130 (Chr19)

(complement)

1-88  (100001-100088)   100% ->
89-269  (101841-102021)   99% ->
270-544  (102975-103249)   98% ->
545-678  (103581-103714)   100% ->
679-828  (104179-104328)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAGCTCCGCACCTCCACCTCTCCGCCGCCTCTGGCGCCCGGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGAGCTCCGCACCTCCACCTCTCCGCCGCCTCTGGCGCCCGGGCTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGAAGCTGCTGCCGCTGCTGATGGCGCAACTCTGGG         CCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100051 GGCGAAGCTGCTGCCGCTGCTGATGGCGCAACTCTGGGGTA...CAGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGAGGCGGCGCTGCTCCCCCAAAACGACACGCGCTTGGACCCCGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101844 CAGAGGCGGCGCTGCTCCCCCAAAACGACACGCGCTTGGACCCCGAAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGGCGCCCCGTGCGCGCGCGGCTCGCAGCCCTGGCAGGTCTCGCTCTT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101894 TATGGCTCCCCGTGCGCGCGCGGCTCGCAGCCCTGGCAGGTCTCGCTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACGGCCTCTCGTTCCACTGCGCGGGTGTCCTGGTGGACCAGAGTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101944 CAACGGCCTCTCGTTCCACTGCGCGGGTGTCCTGGTGGACCAGAGTTGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCTGACGGCCGCGCACTGCGGAAACAA         GCCACTGTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101994 TGCTGACGGCCGCGCACTGCGGAAACAAGTA...CAGGCCACTGTGGGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGAGTAGGGGATGACCACCTGCTGCTTCTTCAGGGCGAGCAGCTCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 102988 CGAGTAGGGGATGACCACCTGCTGCTTCTTCAGGGAGAGCAGCTCCGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GACGACTCGCTCTGTTGTCCATCCCAAGTACCACCAGGGCTCAGGCCCCA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103038 GACCACTCGCTCTGTTGTCCATCCCAAGTACCACCAGGGCTCAGGCCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCCTGCCAAGGCGAACGGATGAGCACGATCTCATGTTGCTAAAGCTGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 103088 TCCTGCCAAGGCGAACGGATGAGCACGATCTCATGTTGCTGAAGCTGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGGCCCGTAGTGCCGGGGCCCCGCGTCCGGGCCCTGCAGCTTCCCTACCG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103138 AGGCCCGTAGTGCTGGGGCCCCGCGTCCGGGCCCTGCAGCTTCCCTACCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGTGCTCAGCCCGGAGACCAGTGCCAGGTTGCTGGCTGGGGCACCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103188 CTGTGCTCAGCCCGGAGACCAGTGCCAGGTTGCTGGCTGGGGCACCACGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCGCCCGGAGAG         TGAAGTACAACAAGGGCCTGACCTGCTCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103238 CCGCCCGGAGAGGCA...CAGTGAAGTACAACAAGGGCCTGACCTGCTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGCATCACTATCCTGAGCCCTAAAGAGTGTGAGGTCTTCTACCCTGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103610 AGCATCACTATCCTGAGCCCTAAAGAGTGTGAGGTCTTCTACCCTGGCGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGTCACCAACAACATGATATGTGCTGGACTGGACCGGGGCCAGGACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103660 GGTCACCAACAACATGATATGTGCTGGACTGGACCGGGGCCAGGACCCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCCAG         AGTGACTCTGGAGGCCCCCTGGTCTGTGACGAGACC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103710 GCCAGGTA...CAGAGTGACTCTGGAGGCCCCCTGGTCTGTGACGAGACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTCCAAGGCATCCTCTCGTGGGGTGTTTACCCCTGTGGCTCTGCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104215 CTCCAAGGCATCCTCTCGTGGGGTGTTTACCCCTGTGGCTCTGCCCAGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TCCAGCTGTCTACACCCAGATCTGCAAATACATGTCCTGGATCAATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104265 TCCAGCTGTCTACACCCAGATCTGCAAATACATGTCCTGGATCAATAAAG

    850     .    :
    815 TCATACGCTCCAAC
        ||||||||||||||
 104315 TCATACGCTCCAAC