seq1 = pF1KE6206.tfa, 594 bp
seq2 = pF1KE6206/gi568815586r_8504287.tfa (gi568815586r:8504287_8707016), 202730 bp

>pF1KE6206 594
>gi568815586r:8504287_8707016 (Chr12)

(complement)

1-156  (99997-100152)   98% ->
157-427  (101532-101802)   100% ->
428-543  (102095-102210)   99% ->
544-594  (102680-102730)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAGCCTCTTGATGAACCGGAGGAAGTTTCTTTACCAATTCAAAAA
        |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 ACCCACAGCCTCTTGATGAACCGGAGGAAGTTTCTTTACCAATTCAAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCCGCTGGGCTAAGGGTCGGCGTGAGACCTACCTGTGCTACGTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100047 TGTCCGCTGGGCTAAGGGTCGGCGTGAGACCTACCTGTGCTACGTAGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAGGCGTGACAGTGCTACATCCTTTTCACTGGACTTTGGTTATCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100097 AGAGGCGTGACAGTGCTACATCCTTTTCACTGGACTTTGGTTATCTTCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AATAAG         AACGGCTGCCACGTGGAATTGCTCTTCCTCCGCTA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100147 AATAAGGTA...CAGAACGGCTGCCACGTGGAATTGCTCTTCCTCCGCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCTCGGACTGGGACCTAGACCCTGGCCGCTGCTACCGCGTCACCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101567 CATCTCGGACTGGGACCTAGACCCTGGCCGCTGCTACCGCGTCACCTGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCACCTCCTGGAGCCCCTGCTACGACTGTGCCCGACATGTGGCCGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101617 TCACCTCCTGGAGCCCCTGCTACGACTGTGCCCGACATGTGGCCGACTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGCGAGGGAACCCCAACCTCAGTCTGAGGATCTTCACCGCGCGCCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101667 CTGCGAGGGAACCCCAACCTCAGTCTGAGGATCTTCACCGCGCGCCTCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTTCTGTGAGGACCGCAAGGCTGAGCCCGAGGGGCTGCGGCGGCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101717 CTTCTGTGAGGACCGCAAGGCTGAGCCCGAGGGGCTGCGGCGGCTGCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCGCCGGGGTGCAAATAGCCATCATGACCTTCAAAG         ATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101767 GCGCCGGGGTGCAAATAGCCATCATGACCTTCAAAGGTG...AAGATTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTTTACTGCTGGAATACTTTTGTAGAAAACCATGAAAGAACTTTCAAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 102100 TTTTACTGCTGGAATACTTTTGTAGAAAACCACGAAAGAACTTTCAAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGGGAAGGGCTGCATGAAAATTCAGTTCGTCTCTCCAGACAGCTTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102150 CTGGGAAGGGCTGCATGAAAATTCAGTTCGTCTCTCCAGACAGCTTCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCATCCTTTTG         CCCCTGTATGAGGTTGATGACTTACGAGAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102200 GCATCCTTTTGGTA...CAGCCCCTGTATGAGGTTGATGACTTACGAGAC

    600     .    :    .    :
    574 GCATTTCGTACTTTGGGACTT
        |||||||||||||||||||||
 102710 GCATTTCGTACTTTGGGACTT