seq1 = pF1KE6204.tfa, 822 bp
seq2 = pF1KE6204/gi568815579r_29107551.tfa (gi568815579r:29107551_29313118), 205568 bp

>pF1KE6204 822
>gi568815579r:29107551_29313118 (Chr19)

(complement)

1-214  (100001-100214)   99% ->
215-822  (104961-105568)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGTCGGTAGCAGCCCGCTCGGGCCCGTTCGCGCCCGTCCTGTCGGC
        ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGTCGGTAGCATCCCGCTCAGGCCCGTTCGCGCCCGTCCTGTCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACGTCCCGCGGGGTGGCGGGCGCGCTGCGGCCCTTGGTGCAGGCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACGTCCCGCGGGGTGGCGGGCGCGCTGCGGCCCTTGGTGCAGGCCACGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCCGCCACCCCGGAGCAGCCTGTGTTGGACCTGAAGCGGCCCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCCGCCACCCCGGAGCAGCCTGTGTTGGACCTGAAGCGGCCCTTCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCCGGGAGTCGCTGAGCGGCCAGGCCGTGCGCCGGCCTTTGGTCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCCGGGAGTCGCTGAGCGGCCAGGCCGTGCGCCGGCCTTTGGTCGCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTGGGCCTCAATG         TCCCTGCTTCTGTTTGTTATTCCCACA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTGGGCCTCAATGGTG...CAGTCCCTGCTTCTGTTTGTTATTCCCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGACATCAAGGTGCCTGACTTCTCTGAATACCGCCGCCTTGAAGTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104988 CAGACATCAAGGTGCCTGACTTCTCTGAATACCGCCGCCTTGAAGTTTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATAGTACGAAGTCTTCAAGAGAAAGCAGCGAGGCTAGGAAAGGTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105038 GATAGTACGAAGTCTTCAAGAGAAAGCAGCGAGGCTAGGAAAGGTTTCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTATTTGGTAACTGGAGTAACTACTGTGGGTGTCGCATATGCTGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105088 CTATTTGGTAACTGGAGTAACTACTGTGGGTGTCGCATATGCTGCCAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATGCCGTCACCCAGTTCGTTTCCAGCATGAGTGCTTCTGCTGATGTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105138 ATGCCGTCACCCAGTTCGTTTCCAGCATGAGTGCTTCTGCTGATGTGTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCCTGGCGAAAATCGAAATCAAGTTATCTGATATTCCAGAAGGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 105188 GCCCTGGCGAAAATCGAAATCAAGTTATCCGATATTCCAGAAGGCAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATGGCTTTCAAATGGAGAGGCAAACCCCTGTTTGTGCGTCATAGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105238 CATGGCTTTCAAATGGAGAGGCAAACCCCTGTTTGTGCGTCATAGAACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGAAGGAAATTGAGCAGGAAGCTGCAGTTGAATTATCACAGTTGAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105288 AGAAGGAAATTGAGCAGGAAGCTGCAGTTGAATTATCACAGTTGAGGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCACAGCATGATCTAGATCGAGTAAAGAAACCTGAATGGGTTATCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105338 CCACAGCATGATCTAGATCGAGTAAAGAAACCTGAATGGGTTATCCTGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGGTGTTTGCACTCATCTTGGCTGTGTACCCATTGCAAATGCAGGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105388 AGGTGTTTGCACTCATCTTGGCTGTGTACCCATTGCAAATGCAGGAGATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTGGTGGTTATTACTGCCCTTGCCATGGGTCACACTATGATGCATCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105438 TTGGTGGTTATTACTGCCCTTGCCATGGGTCACACTATGATGCATCTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGGATCAGATTGGGTCCTGCTCCTCTCAACCTTGAAGTCCCCACGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105488 AGGATCAGATTGGGTCCTGCTCCTCTCAACCTTGAAGTCCCCACGTATGA

    800     .    :    .    :    .    :
    792 GTTCACCAGTGACGATATGGTGATTGTTGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 105538 GTTCACCAGTGACGATATGGTGATTGTTGGT