seq1 = pF1KE6203.tfa, 669 bp
seq2 = pF1KE6203/gi568815589r_34535635.tfa (gi568815589r:34535635_34737697), 202063 bp

>pF1KE6203 669
>gi568815589r:34535635_34737697 (Chr9)

(complement)

1-151  (100001-100151)   100% ->
152-352  (100278-100478)   100% ->
353-445  (100609-100701)   100% ->
446-669  (101840-102063)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTGGGCCGTGGGCCGGCGGTGGGCGTGGGCCGCGCTGCTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTGGGCCGTGGGCCGGCGGTGGGCGTGGGCCGCGCTGCTCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCGCAGCGGTGCTGACCCAGGTCGTCTGGCTCTGGCTGGGTACGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCGCAGCGGTGCTGACCCAGGTCGTCTGGCTCTGGCTGGGTACGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCGTCTTCCAGCGCGAAGAGATAGCGCAGTTGGCGCGGCAGTACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTCGTCTTCCAGCGCGAAGAGATAGCGCAGTTGGCGCGGCAGTACGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 G         GGCTGGACCACGAGCTGGCCTTCTCTCGTCTGATCGTGGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTG...CAGGGCTGGACCACGAGCTGGCCTTCTCTCGTCTGATCGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGCGGCGGCTGCACCCAGGCCACGTGCTGCCCGACGAGGAGCTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100318 GCTGCGGCGGCTGCACCCAGGCCACGTGCTGCCCGACGAGGAGCTGCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGTGTTCGTGAATGCGGGTGGCTGGATGGGCGCCATGTGCCTTCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100368 GGGTGTTCGTGAATGCGGGTGGCTGGATGGGCGCCATGTGCCTTCTGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCTCGCTGTCCGAGTATGTGCTGCTCTTCGGCACCGCCTTGGGCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100418 GCCTCGCTGTCCGAGTATGTGCTGCTCTTCGGCACCGCCTTGGGCTCCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGGCCACTCGG         GGCGCTACTGGGCTGAGATCTCGGATACCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100468 CGGCCACTCGGGTC...CAGGGCGCTACTGGGCTGAGATCTCGGATACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCATCTCTGGCACCTTCCACCAGTGGAGAGAGGGCACCACCAAAAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100639 TCATCTCTGGCACCTTCCACCAGTGGAGAGAGGGCACCACCAAAAGTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTCTTCTACCCAG         GGGAGACGGTAGTACACGGGCCTGGTGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100689 GTCTTCTACCCAGGTG...CAGGGGAGACGGTAGTACACGGGCCTGGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGCAACAGCTGTGGAGTGGGGGCCAAACACATGGATGGTGGAGTACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101868 GGCAACAGCTGTGGAGTGGGGGCCAAACACATGGATGGTGGAGTACGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGGGCGTCATCCCATCCACCCTGGCCTTCGCGCTGGCCGACACTGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101918 GGGGCGTCATCCCATCCACCCTGGCCTTCGCGCTGGCCGACACTGTCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGCACCCAGGACTTCCTCACCCTCTTCTATACTCTTCGCTCCTATGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101968 AGCACCCAGGACTTCCTCACCCTCTTCTATACTCTTCGCTCCTATGCTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    624 GGGCCTCCGGCTTGAGCTCACCACCTACCTCTTTGGCCAGGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102018 GGGCCTCCGGCTTGAGCTCACCACCTACCTCTTTGGCCAGGACCCT