seq1 = pF1KE6182.tfa, 426 bp
seq2 = pF1KE6182/gi568815596r_175078291.tfa (gi568815596r:175078291_175281393), 203103 bp

>pF1KE6182 426
>gi568815596r:175078291_175281393 (Chr2)

(complement)

1-39  (100001-100039)   100% ->
40-120  (101216-101296)   100% ->
121-314  (102144-102337)   100% ->
315-426  (102992-103103)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCGCCTGCGCCAAGCTCGCCTGCACCCCCTCTCTG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100001 ATGTTCGCCTGCGCCAAGCTCGCCTGCACCCCCTCTCTGGTG...TAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCGAGCTGGATCCAGAGTTGCATACAGACCAATTTCTGCATCAGTGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101218 CCGAGCTGGATCCAGAGTTGCATACAGACCAATTTCTGCATCAGTGTTAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCGACCAGAGGCTAGTAGGACTGGAGAG         GGCTCTACGGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 101268 CTCGACCAGAGGCTAGTAGGACTGGAGAGGTA...CAGGGCTCTACGGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTTAATGGGGCCCAGAATGGTGTGTCTCAGCTAATCCAAAGGGAGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102156 TTTAATGGGGCCCAGAATGGTGTGTCTCAGCTAATCCAAAGGGAGTTTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GACCAGTGCAATCAGCAGAGACATTGATACTGCTGCCAAATTTATTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102206 GACCAGTGCAATCAGCAGAGACATTGATACTGCTGCCAAATTTATTGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGGTGCTGCAACAGTAGGAGTGGCTGGTTCTGGTGCTGGTATTGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102256 CAGGTGCTGCAACAGTAGGAGTGGCTGGTTCTGGTGCTGGTATTGGAACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCTTTGGCAGCCTTATCATTGGTTATGCCAG         AAACCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102306 GTCTTTGGCAGCCTTATCATTGGTTATGCCAGGTA...TAGAAACCCTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCTGAAGCAGCAGCTGTTCTCATATGCTATCCTGGGATTTGCCTTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103001 GCTGAAGCAGCAGCTGTTCTCATATGCTATCCTGGGATTTGCCTTGTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGCTATGGGTCTCTTTTGTTTGATGGTTGCTTTCTTGATTTTGTTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103051 AAGCTATGGGTCTCTTTTGTTTGATGGTTGCTTTCTTGATTTTGTTTGCC

    450 
    424 ATG
        |||
 103101 ATG