seq1 = pF1KE6180.tfa, 381 bp
seq2 = pF1KE6180/gi568815584f_50213021.tfa (gi568815584f:50213021_50422719), 209699 bp

>pF1KE6180 381
>gi568815584f:50213021_50422719 (Chr14)

1-40  (100001-100040)   100% ->
41-152  (108463-108574)   99% ->
153-361  (109491-109699)   99% ->
362-381  (112589-112608)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGCTGTGCGGTCTCTGAGCAGCGACTCACCTGTGCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100001 ATGTGCTGTGCGGTCTCTGAGCAGCGACTCACCTGTGCAGGTC...TAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCAAATGATGCTGTTTGGAAAAATTTCCCAGCAGTTGTGTGGCGTAAAGA
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108464 TCAAATGATGCCGTTTGGAAAAATTTCCCAGCAGTTGTGTGGCGTAAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACTCCCATGGTCATGTGACTCCAGATACTTCTGGGGCTGGTTGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108514 AACTCCCATGGTCATGTGACTCCAGATACTTCTGGGGCTGGTTGAATGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGTTTAATAA         GGTGGATTATGATCGCATCAGGGATGTTGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 108564 GTGTTTAATAAGTA...CAGGGTGGATTATGATCGCATCAGGGATGTTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCCTGATAGGGCGGCATCCGAGTGGTTGCTGCGCTGTGGGGCCATGGTGC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109521 CCCTGACAGGGCGGCATCCGAGTGGTTGCTGCGCTGTGGGGCCATGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCTACCATGGCCAGGAGAGGTGGCAGAAGGACTACAACCACCTTCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109571 GCTACCATGGCCAGGAGAGGTGGCAGAAGGACTACAACCACCTTCCAACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCCCTCTGGACAAATACAAGATTCAGGCGATCGACGCCACCGACTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109621 GGCCCTCTGGACAAATACAAGATTCAGGCGATCGACGCCACCGACTCTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TATCATGAGCATTGGATTTGATCACATGG         AAACCTCAAATA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109671 TATCATGAGCATTGGATTTGATCACATGGGTA...CAGAAACCTCAAATA

    400     .
    374 TTTGTTGT
        ||||||||
 112601 TTTGTTGT