seq1 = pF1KE6176.tfa, 330 bp
seq2 = pF1KE6176/gi568815591r_110863500.tfa (gi568815591r:110863500_111621447), 757948 bp

>pF1KE6176 330
>gi568815591r:110863500_111621447 (Chr7)

(complement)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-248  (134107-134214)   95% ->
249-305  (657892-657948)   100% ->
306-330  (658358-658382)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACAGTCACAAGGGTGGGTGAAAAGATACATCAAGGCCTTTTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACAGTCACAAGGGTGGGTGAAAAGATACATCAAGGCCTTTTGTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGCTTCTTTGTGGCGGTGCCTGTGGCAGTGACTTTCTTGGATCGGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGCTTCTTTGTGGCGGTGCCTGTGGCAGTGACTTTCTTGGATCGGGTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTGTGTGGCAAGAGTAGAAGGAGCATCGATGCAG         CCTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 CCTGTGTGGCAAGAGTAGAAGGAGCATCGATGCAGGTG...TAGCCTTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTGAATCCTGGGGGGAGCCAGTCATCTGATGTGGTGCTTTTGAACCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134113 TTGAATCCTGGGGGGAGCCAGTCATCTGATGTGGTGCTTTTGAACCACTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAAGTGAGGAATTTTGAAGTACACCGTGGTGACATTGTATCATTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134163 GAAAGTGAGGAATTTTGAAGTACACCGTGGTGACATTGTATCATTGGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCCTAA         AAACCCAGAACAGAAGATCATTAAGAGAGTGATT
        -----||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134213      AAGTA...TAAAAACCCAGAACAGAAGATCATTAAGAGAGTGATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTCTTGAAGGAGATATTGTCAG         AGATGGGAGAAAACTGAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 657926 GCTCTTGAAGGAGATATTGTCAGGTA...TAGAGATGGGAGAAAACTGAA

    350     .
    324 AAGGATA
        |||||||
 658376 AAGGATA