seq1 = pF1KE6168.tfa, 423 bp
seq2 = pF1KE6168/gi568815579f_10451930.tfa (gi568815579f:10451930_10653064), 201135 bp

>pF1KE6168 423
>gi568815579f:10451930_10653064 (Chr19)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-123  (100116-100192)   100% ->
124-243  (100276-100395)   100% ->
244-423  (100956-101135)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTGGGAAACCGCGACACTCACTGTACTTCATTGGCTACCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGGGTGGGAAACCGCGACACTCACTGTACTTCATTGGCTACCAAGGTA.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      ATGACTTCCTGCTGTACCTGGACCCTCACTACTGCCAGCCCACTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..CAGATGACTTCCTGCTGTACCTGGACCCTCACTACTGCCAGCCCACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGATGTCAGCCAGGCCGACTTCCCCCTGGAG         TCCTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100161 TGGATGTCAGCCAGGCCGACTTCCCCCTGGAGGTG...CAGTCCTTCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TGCACCTCGCCCCGCAAGATGGCCTTTGCCAAGATGGACCCAAGCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100285 TGCACCTCGCCCCGCAAGATGGCCTTTGCCAAGATGGACCCAAGCTGTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGTGGGCTTCTATGCTGGAGACAGGAAGGAGTTTGAGACACTCTGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100335 CGTGGGCTTCTATGCTGGAGACAGGAAGGAGTTTGAGACACTCTGCTCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCTGACCAGG         GTCCTCAGCTCCTCCTCAGCCACAGAGCGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100385 AGCTGACCAGGGTG...CAGGTCCTCAGCTCCTCCTCAGCCACAGAGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TACCCCATGTTCACCCTGGCCGAGGGCCATGCTCAGGACCACAGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100986 TACCCCATGTTCACCCTGGCCGAGGGCCATGCTCAGGACCACAGCCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGACCTCTGCTCCCAGCTCGCCCAGCCCACACTCCGGCTCCCTCGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101036 CGACCTCTGCTCCCAGCTCGCCCAGCCCACACTCCGGCTCCCTCGCACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGCGGCTCCTCAGGGCCAAACGCCCCAGCTCTGAGGACTTTGTGTTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101086 GGCGGCTCCTCAGGGCCAAACGCCCCAGCTCTGAGGACTTTGTGTTTTTA