seq1 = pF1KE6162.tfa, 516 bp
seq2 = pF1KE6162/gi568815577f_32198972.tfa (gi568815577f:32198972_32411993), 213022 bp

>pF1KE6162 516
>gi568815577f:32198972_32411993 (Chr21)

1-106  (100001-100106)   100% ->
107-206  (107669-107768)   99% ->
207-516  (112713-113022)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAACGGGACCAACGCCTCTGCCCCATACTACAGCTATGAATACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAACGGGACCAACGCCTCTGCCCCATACTACAGCTATGAATACTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGACTATCTGGACCTCATTCCCGTGGACGAGAAGAAGCTGAAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGACTATCTGGACCTCATTCCCGTGGACGAGAAGAAGCTGAAAGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAAAC         ATTCCATCGTGATCGCATTCTGGGTTAGCCTGGCT
        ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100101 ACAAACGTA...CAGATTCCATCGTGATCGCATTCTGGGTGAGCCTGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCTTCGTGGTGCTGCTCTTCCTCATCTTGCTCTACATGTCCTGGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107704 GCCTTCGTGGTGCTGCTCTTCCTCATCTTGCTCTACATGTCCTGGTCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCCCCGCAGATGAG         GAACAGCCCCAAGCACCACCAAACAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 107754 CTCCCCGCAGATGAGGTG...CAGGAACAGCCCCAAGCACCACCAAACAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCCCTGGAGTCACGGCCTCAACCTCCACCTCTGCATCCAGAAGTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112739 GCCCCTGGAGTCACGGCCTCAACCTCCACCTCTGCATCCAGAAGTGCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCGTGCCACAGGGAACCCCTGGCAACCTCACAGGCTCAGGCGAGCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112789 CCGTGCCACAGGGAACCCCTGGCAACCTCACAGGCTCAGGCGAGCTCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAGCCAGGGAGCAGAACTGGCCCTGACCAGCCGCTACGACAGGAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112839 GGAGCCAGGGAGCAGAACTGGCCCTGACCAGCCGCTACGACAGGAGAGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCTCCACGTTGCCCCTCGGGGGTTTCCAGACCCACCCCACTCTCCTCTGG
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112889 CCTCCACCTTGCCCCTCGGGGGTTTCCAGACCCACCCCACTCTCCTCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAACTGACCCTCAATGGGGGTCCCCTCGTCAGGAGCAAGCCCAGCGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112939 GAACTGACCCTCAATGGGGGTCCCCTCGTCAGGAGCAAGCCCAGCGAGCC

    500     .    :    .    :    .    :
    483 TCCCCCTGGAGACAGGACCTCTCAATTGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112989 TCCCCCTGGAGACAGGACCTCTCAATTGCAGAGC