seq1 = pF1KE6153.tfa, 423 bp
seq2 = pF1KE6153/gi568815585f_28562409.tfa (gi568815585f:28562409_28778099), 215691 bp

>pF1KE6153 423
>gi568815585f:28562409_28778099 (Chr13)

1-101  (100000-100099)   99% ->
102-162  (102101-102161)   100% ->
163-264  (106065-106166)   100% ->
265-358  (109931-110024)   100% ->
359-423  (115627-115691)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGCCAGAGGACTTGGATCTGAGCTAAAGGACAGTATTCCAGTTAC
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GAATGCCAGAGGACTTGGATCTGAGCTAAAGGACAGTATTCCAGTTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAACTTTCAGCAAGTGGACCTTTTGAAAGTCATGATCTTCTTCGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 TGAACTTTCAGCAAGTGGACCTTTTGAAAGTCATGATCTTCTTCGGAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 G         TTTTTCTTGTGTGAAAAATGAACTTTTGCCTAGTCATCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 GGTA...CAGTTTTTCTTGTGTGAAAAATGAACTTTTGCCTAGTCATCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTGAATTATCAGAAAAAAAT         TTCCAGCTCAACCAAGATAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102141 CTTGAATTATCAGAAAAAAATGTA...TAGTTCCAGCTCAACCAAGATAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AATGAATTTTTCCACACTGAGAAACATTCAGGGTCTATTTGCTCCGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106085 AATGAATTTTTCCACACTGAGAAACATTCAGGGTCTATTTGCTCCGCTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AATTACAGATGGAATTCAAGGCAGTGCAGCAG         GTTCAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 106135 AATTACAGATGGAATTCAAGGCAGTGCAGCAGGTG...AAGGTTCAGCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTTCCATTTCTTTCAAGCTCAAATCTTTCACTGGATGTTTTGAGGGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109940 CTTCCATTTCTTTCAAGCTCAAATCTTTCACTGGATGTTTTGAGGGGTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGATGAGACTATTGGATTTGAGGATATTCTTAATG         ATCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 109990 TGATGAGACTATTGGATTTGAGGATATTCTTAATGGTA...CAGATCCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CACAAAGCGAAGTCATGGGAGAGCCACACTTGATGGTGGAATATAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115633 CACAAAGCGAAGTCATGGGAGAGCCACACTTGATGGTGGAATATAAACTT

    450     .
    415 GGTTTACTG
        |||||||||
 115683 GGTTTACTG