seq1 = pF1KE6147.tfa, 435 bp
seq2 = pF1KE6147/gi568815587f_112126444.tfa (gi568815587f:112126444_112333552), 207109 bp

>pF1KE6147 435
>gi568815587f:112126444_112333552 (Chr11)

1-83  (100001-100083)   100% ->
84-163  (102151-102230)   100% ->
164-186  (103765-103787)   100% ->
187-243  (104183-104239)   100% ->
244-314  (106720-106790)   100% ->
315-435  (106989-107109)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCACGGAAGGTGGTGGCCGTCGCTGCCAGGCACAAGTGTCCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCACGGAAGGTGGTGGCCGTCGCTGCCAGGCACAAGTGTCCCGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCTCCTTCAGCGCGAGCCACCGATTGTACAG         TAAATTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100051 CATCTCCTTCAGCGCGAGCCACCGATTGTACAGGTA...CAGTAAATTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TAAGTGATGAAGAAAACTTGAAACTGTTTGGGAAATGCAACAATCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102159 TAAGTGATGAAGAAAACTTGAAACTGTTTGGGAAATGCAACAATCCAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCCATGGGCACAATTATAAAG         TTGTGGTGACAGTACATGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102209 GGCCATGGGCACAATTATAAAGGTG...TAGTTGTGGTGACAGTACATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAG         ATTGACCCTGCTACGGGAATGGTTATGAATCTGGCTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103784 AGAGGTA...TAGATTGACCCTGCTACGGGAATGGTTATGAATCTGGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATCTCAAAAAATATATGGAG         GAGGCGATTATGCAGCCCCTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104220 ATCTCAAAAAATATATGGAGGTA...TAGGAGGCGATTATGCAGCCCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 GATCATAAGAATCTGGATATGGATGTGCCATACTTTGCAGATGTGGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106741 GATCATAAGAATCTGGATATGGATGTGCCATACTTTGCAGATGTGGTGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315          CACGACTGAAAATGTAGCTGTTTATATCTGGGACAACCTCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106791 GTG...TAGCACGACTGAAAATGTAGCTGTTTATATCTGGGACAACCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 AGAAAGTTCTTCCTGTAGGAGTTCTTTATAAAGTAAAAGTATACGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107030 AGAAAGTTCTTCCTGTAGGAGTTCTTTATAAAGTAAAAGTATACGAAACT

    450     .    :    .    :    .    :
    406 GACAATAATATTGTGGTTTATAAAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 107080 GACAATAATATTGTGGTTTATAAAGGAGAA