seq1 = pF1KE6135.tfa, 315 bp
seq2 = pF1KE6135/gi568815579f_5590508.tfa (gi568815579f:5590508_5791618), 201111 bp

>pF1KE6135 315
>gi568815579f:5590508_5791618 (Chr19)

1-93  (100001-100093)   100% ->
94-228  (100812-100946)   100% ->
229-315  (101025-101111)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCTACGCTACCCTATGGCCGTGGGCCTCAACAAGGGCCACAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCTACGCTACCCTATGGCCGTGGGCCTCAACAAGGGCCACAAAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCAAGAACGTGAGCAAGCCCAGGCACAGCCGACGCCGCGGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 GACCAAGAACGTGAGCAAGCCCAGGCACAGCCGACGCCGCGGGGTG...T

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   CGTCTGACCAAACACACCAAGTTCGTGCGGGACATGATTCGGGAGGTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100810 AGCGTCTGACCAAACACACCAAGTTCGTGCGGGACATGATTCGGGAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTGGCTTTGCCCCGTACGAGCGGCGCGCCATGGAGTTACTGAAGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100860 TGTGGCTTTGCCCCGTACGAGCGGCGCGCCATGGAGTTACTGAAGGTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGGACAAACGGGCCCTCAAATTTATCAAGAAAAGG         GTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100910 CAAGGACAAACGGGCCCTCAAATTTATCAAGAAAAGGGTA...CAGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGACGCACATCCGCGCCAAGAGGAAGCGGGAGGAGCTGAGCAACGTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101029 GGACGCACATCCGCGCCAAGAGGAAGCGGGAGGAGCTGAGCAACGTACTG

    300     .    :    .    :    .    :
    283 GCCGCCATGAGGAAAGCTGCTGCCAAGAAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101079 GCCGCCATGAGGAAAGCTGCTGCCAAGAAAGAC