seq1 = pF1KE6134.tfa, 429 bp
seq2 = pF1KE6134/gi568815589f_113057726.tfa (gi568815589f:113057726_113262914), 205189 bp

>pF1KE6134 429
>gi568815589f:113057726_113262914 (Chr9)

1-73  (99995-100068)   94% ->
74-263  (103784-103973)   100% ->
264-429  (105024-105189)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGC GATGCATTTCATCTTCTCAGATACAGCGGTGCTTCTGTTTGATT
         |  |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99995 CTTTCAGATGCATTTCATCTTCTCAGATACAGCGGTGCTTCTGTTTGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 TCTGGAGTGTCCACAGTCCTGCTG         GCATGGCCCTTTCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100045 TCTGGAGTGTCCACAGTCCTGCTGGTA...CAGGCATGGCCCTTTCGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     91 TTGGTGCTCCTGCTTCTGGCTGTACTGTATGAAGGCATCAAGGTTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103801 TTGGTGCTCCTGCTTCTGGCTGTACTGTATGAAGGCATCAAGGTTGGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 AGCCAAGCTGCTCAACCAGGTACTGGTGAACCTGCCAACCTCCATCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103851 AGCCAAGCTGCTCAACCAGGTACTGGTGAACCTGCCAACCTCCATCAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191 AGCAGACCATCGCAGAGACAGACGGGGACTCTGCAGGCTCAGATTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103901 AGCAGACCATCGCAGAGACAGACGGGGACTCTGCAGGCTCAGATTCATTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241 CCTGTTGGCAGAACCCACCACAG         GTGGTATTTGTGTCACTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103951 CCTGTTGGCAGAACCCACCACAGGTA...TAGGTGGTATTTGTGTCACTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282 TGGCCAGTCTCTAATCCATGTCATCCAGGTGGTCATCGGCTACTTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105042 TGGCCAGTCTCTAATCCATGTCATCCAGGTGGTCATCGGCTACTTCATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    332 TGCTGGCCGTAATGTCCTACAACACCTGGATTTTCCTTGGTGTGGTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105092 TGCTGGCCGTAATGTCCTACAACACCTGGATTTTCCTTGGTGTGGTCTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    382 GGCTCTGCTGTGGGCTACTACCTAGCTTACCCACTTCTCAGCACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105142 GGCTCTGCTGTGGGCTACTACCTAGCTTACCCACTTCTCAGCACAGCT