seq1 = pF1KE6130.tfa, 423 bp
seq2 = pF1KE6130/gi568815586r_53565317.tfa (gi568815586r:53565317_53772614), 207298 bp

>pF1KE6130 423
>gi568815586r:53565317_53772614 (Chr12)

(complement)

1-39  (100001-100039)   100% ->
40-117  (102667-102744)   100% ->
118-311  (103274-103467)   100% ->
312-423  (107187-107298)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCGCCTGCTCCAAGTTTGTCTCCACTCCCTCCTTG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100001 ATGTTCGCCTGCTCCAAGTTTGTCTCCACTCCCTCCTTGGTG...TAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CAAGAGCACCTCACAGCTGCTGAGCCGTCCGCTATCTGCAGTGGTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102669 CAAGAGCACCTCACAGCTGCTGAGCCGTCCGCTATCTGCAGTGGTGCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACGACCGGAGATACTGACAGATGAG         AGCCTCAGCAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102719 AACGACCGGAGATACTGACAGATGAGGTA...CAGAGCCTCAGCAGCTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCAGTCTCATGTCCCCTTACCTCACTTGTCTCTAGCCGCAGCTTCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103289 GCAGTCTCATGTCCCCTTACCTCACTTGTCTCTAGCCGCAGCTTCCAAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAGCGCCATTTCAAGGGACATCGACACAGCAGCCAAGTTCATTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103339 CAGCGCCATTTCAAGGGACATCGACACAGCAGCCAAGTTCATTGGAGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGGCTGCCACAGTTGGGGTGGCTGGTTCTGGGGCTGGGATTGGAACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103389 GGGCTGCCACAGTTGGGGTGGCTGGTTCTGGGGCTGGGATTGGAACTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTGGGAGCCTCATCATTGGTTATGCCAG         GAACCCTTCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 103439 TTTGGGAGCCTCATCATTGGTTATGCCAGGTA...CAGGAACCCTTCTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAGCAACAGCTCTTCTCCTACGCCATTCTGGGCTTTGCCCTCTCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107199 GAAGCAACAGCTCTTCTCCTACGCCATTCTGGGCTTTGCCCTCTCGGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCATGGGGCTCTTTTGTCTGATGGTAGCCTTTCTCATCCTCTTTGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107249 CCATGGGGCTCTTTTGTCTGATGGTAGCCTTTCTCATCCTCTTTGCCATG