seq1 = pF1KE6127.tfa, 414 bp
seq2 = pF1KE6127/gi568815597r_156600029.tfa (gi568815597r:156600029_156805446), 205418 bp

>pF1KE6127 414
>gi568815597r:156600029_156805446 (Chr1)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-249  (104395-104573)   100% ->
250-366  (104789-104905)   100% ->
367-414  (105371-105418)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCAACTTCTCTGGCAACTGGAAAATCATCCGATCGGAAAACTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCAACTTCTCTGGCAACTGGAAAATCATCCGATCGGAAAACTTCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAATTGCTCAAAGTGCTGG         GGGTGAATGTGATGCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 GGAATTGCTCAAAGTGCTGGGTA...CAGGGGTGAATGTGATGCTGAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGATTGCTGTGGCTGCAGCGTCCAAGCCAGCAGTGGAGATCAAACAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104416 AGATTGCTGTGGCTGCAGCGTCCAAGCCAGCAGTGGAGATCAAACAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAGACACTTTCTACATCAAAACCTCCACCACCGTGCGCACCACAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104466 GGAGACACTTTCTACATCAAAACCTCCACCACCGTGCGCACCACAGAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAACTTCAAGGTTGGGGAGGAGTTTGAGGAGCAGACTGTGGATGGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104516 TAACTTCAAGGTTGGGGAGGAGTTTGAGGAGCAGACTGTGGATGGGAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTGTAAG         AGCCTGGTGAAATGGGAGAGTGAGAATAAAATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104566 CCTGTAAGGTG...CAGAGCCTGGTGAAATGGGAGAGTGAGAATAAAATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCTGTGAGCAGAAGCTCCTGAAGGGAGAGGGCCCCAAGACCTCGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104822 GTCTGTGAGCAGAAGCTCCTGAAGGGAGAGGGCCCCAAGACCTCGTGGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGAGAACTGACCAACGATGGGGAACTGATCCTG         ACCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104872 CAGAGAACTGACCAACGATGGGGAACTGATCCTGGTA...CAGACCATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGGCGGATGACGTTGTGTGCACCAGGGTCTACGTCCGAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105378 CGGCGGATGACGTTGTGTGCACCAGGGTCTACGTCCGAGAG