seq1 = pF1KE6125.tfa, 528 bp
seq2 = pF1KE6125/gi568815596r_27209915.tfa (gi568815596r:27209915_27422517), 212603 bp

>pF1KE6125 528
>gi568815596r:27209915_27422517 (Chr2)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-186  (109409-109524)   100% ->
187-279  (109746-109838)   100% ->
280-375  (109929-110024)   100% ->
376-408  (110272-110304)   100% ->
409-461  (110567-110619)   100% ->
462-528  (112537-112603)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACTCTGGCGGGCATACCAGCGGGCCCTGGCCGCTCACCCGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACTCTGGCGGGCATACCAGCGGGCCCTGGCCGCTCACCCGTGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTACAGGTCCTGACAGCTG         GGTCCCTGATGGGCCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 AGTACAGGTCCTGACAGCTGGTG...TAGGGTCCCTGATGGGCCTGGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACATTATCTCACAGCAGCTGGTGGAGAGGCGGGGTCTGCAGGAACACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109430 ACATTATCTCACAGCAGCTGGTGGAGAGGCGGGGTCTGCAGGAACACCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGAGGCCGGACTCTGACCATGGTGTCCCTGGGCTGTGGCTTTGTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 109480 AGAGGCCGGACTCTGACCATGGTGTCCCTGGGCTGTGGCTTTGTGGTA..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    187     GGCCCTGTGGTAGGAGGCTGGTACAAGGTTTTGGATCGGTTCATCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109530 .CAGGGCCCTGTGGTAGGAGGCTGGTACAAGGTTTTGGATCGGTTCATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGGCACCACCAAAGTGGATGCACTGAAGAAGATGTTGTTGGATCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 109792 CTGGCACCACCAAAGTGGATGCACTGAAGAAGATGTTGTTGGATCAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280       GGGGGCTTTGCCCCGTGTTTTCTAGGCTGCTTTCTCCCACTGGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109842 ...TAGGGGGGCTTTGCCCCGTGTTTTCTAGGCTGCTTTCTCCCACTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGGGGCACTTAATGGACTGTCAGCCCAGGACAACTGGGCCAAACTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109973 AGGGGCACTTAATGGACTGTCAGCCCAGGACAACTGGGCCAAACTACAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GG         GATTATCCTGATGCCCTTATCACCAACTACTAT      
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 110023 GGGTG...CAGGATTATCCTGATGCCCTTATCACCAACTACTATGTA...

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    409    CTATGGCCTGCTGTGCAGTTAGCCAACTTCTACCTGGTCCCCCTTCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110564 CAGCTATGGCCTGCTGTGCAGTTAGCCAACTTCTACCTGGTCCCCCTTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TTACAG         GTTGGCCGTTGTCCAATGTGTTGCTGTTATCTGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110614 TTACAGGTA...TAGGTTGGCCGTTGTCCAATGTGTTGCTGTTATCTGGA

    550     .    :    .    :    .    :
    497 ACTCCTACCTGTCCTGGAAGGCACATCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 112572 ACTCCTACCTGTCCTGGAAGGCACATCGGCTC