seq1 = pF1KE6114.tfa, 501 bp
seq2 = pF1KE6114/gi568815581f_39565360.tfa (gi568815581f:39565360_39766106), 200747 bp

>pF1KE6114 501
>gi568815581f:39565360_39766106 (Chr17)

1-110  (100001-100110)   100% ->
111-501  (100357-100747)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTACCTCAGAGCTGAGCTGCGAGGTGTCGGAGGAGAACTGTGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTACCTCAGAGCTGAGCTGCGAGGTGTCGGAGGAGAACTGTGAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGGAGGCCTTCTGGGCAGAATGGAAGGATCTGACACTGTCCACACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGGAGGCCTTCTGGGCAGAATGGAAGGATCTGACACTGTCCACACGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGAGGAGGG         CTGCTCCCTGCATGAGGAGGACACCCAGAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGAGGAGGGGTG...CAGCTGCTCCCTGCATGAGGAGGACACCCAGAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATGAGACCTACCACCAGCAGGGGCAGTGCCAGGTGCTGGTGCAGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100388 CATGAGACCTACCACCAGCAGGGGCAGTGCCAGGTGCTGGTGCAGCGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCCTGGCTGATGATGCGGATGGGCATCCTCGGCCGTGGGCTGCAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100438 GCCCTGGCTGATGATGCGGATGGGCATCCTCGGCCGTGGGCTGCAGGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCAGCTGCCCTACCAGCGGGTACTGCCGCTGCCCATCTTCACCCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100488 ACCAGCTGCCCTACCAGCGGGTACTGCCGCTGCCCATCTTCACCCCTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGATGGGCGCCACCAAGGAGGAGCGTGAGGACACCCCCATCCAGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100538 AAGATGGGCGCCACCAAGGAGGAGCGTGAGGACACCCCCATCCAGCTTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGAGCTGCTGGCGCTGGAGACAGCCCTGGGTGGCCAGTGTGTGGACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100588 GGAGCTGCTGGCGCTGGAGACAGCCCTGGGTGGCCAGTGTGTGGACCGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGGAGGTGGCTGAGATCACAAAGCAGCTGCCCCCTGTGGTGCCTGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100638 AGGAGGTGGCTGAGATCACAAAGCAGCTGCCCCCTGTGGTGCCTGTCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGCCCGGTGCCCTTCGTCGCTCCCTGTCCCGCTCCATGTCCCAGGAAGC
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100688 AAGCCCGGTGCACTTCGTCGCTCCCTGTCCCGCTCCATGTCCCAGGAAGC

    500     .    :
    492 ACAGAGAGGC
        ||||||||||
 100738 ACAGAGAGGC