seq1 = pF1KE6109.tfa, 450 bp
seq2 = pF1KE6109/gi568815583r_74823660.tfa (gi568815583r:74823660_75038014), 214355 bp

>pF1KE6109 450
>gi568815583r:74823660_75038014 (Chr15)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-217  (108783-108899)   100% ->
218-339  (111128-111249)   100% ->
340-450  (114245-114355)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGCGCCGCTCTCCGCCGCTGCGCTGTGGCCGCAACCACCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGCGCCGCTCTCCGCCGCTGCGCTGTGGCCGCAACCACCCGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACCCTCGAGGCCTCCTGCACTCCGCCCGGACCCCCGGCCCCGCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACCCTCGAGGCCTCCTGCACTCCGCCCGGACCCCCGGCCCCGCCGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          CTATCCAGTCAGTTCGCTGCTATTCCCATGGGTCACAGGAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTA...TAGCTATCCAGTCAGTTCGCTGCTATTCCCATGGGTCACAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACAGATGAGGAGTTTGATGCTCGCTGGGTAACATACTTCAACAAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108824 ACAGATGAGGAGTTTGATGCTCGCTGGGTAACATACTTCAACAAGCCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATAGATGCCTGGGAATTGCGTAAAG         GGATAAACACACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108874 TATAGATGCCTGGGAATTGCGTAAAGGTA...CAGGGATAAACACACTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTACCTATGATATGGTTCCAGAGCCCAAAATCATTGATGCTGCTTTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111143 TTACCTATGATATGGTTCCAGAGCCCAAAATCATTGATGCTGCTTTGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCATGCAGACGGTTAAATGATTTTGCTAGTACAGTTCGTATCCTAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111193 GCATGCAGACGGTTAAATGATTTTGCTAGTACAGTTCGTATCCTAGAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTTAAG         GACAAAGCAGGACCTCATAAGGAAATCTACCCCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111243 TGTTAAGGTC...CAGGACAAAGCAGGACCTCATAAGGAAATCTACCCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGTCATCCAGGAACTTAGACCAACTTTAAATGAACTGGGAATCTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114279 ATGTCATCCAGGAACTTAGACCAACTTTAAATGAACTGGGAATCTCCACT

    450     .    :    .    :    .
    424 CCGGAGGAACTGGGCCTTGACAAAGTG
        |||||||||||||||||||||||||||
 114329 CCGGAGGAACTGGGCCTTGACAAAGTG