seq1 = pF1KE6095.tfa, 978 bp
seq2 = pF1KE6095/gi568815587f_56175639.tfa (gi568815587f:56175639_56376616), 200978 bp

>pF1KE6095 978
>gi568815587f:56175639_56376616 (Chr11)

1-978  (100001-100978)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGGGTTGCCTTCAGATATGGATCTATACAAGCTTCAATTAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGGGTTGCCTTCAGATATGGATCTATACAAGCTTCAATTAAACAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTTACTGAAGTCACCATGTTTATATTAATAAGCTTCACAGAAGAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTTACTGAAGTCACCATGTTTATATTAATAAGCTTCACAGAAGAATTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGTGCAAGTCTTCCTATTTTTATTATTTTTAGCAATCTATCTATTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGTGCAAGTCTTCCTATTTTTATTATTTTTAGCAATCTATCTATTCACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTAATAGGCAATTTAGGGCTGGTTGTACCGATCATTGGGGATTTCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTAATAGGCAATTTAGGGCTGGTTGTACCGATCATTGGGGATTTCTGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCACAGCCCAATGTACTATTTTCTTGGTGTTTTATCATTCTTGGATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCACAGCCCAATGTACTATTTTCTTGGTGTTTTATCATTCTTGGATGTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTATTCTACAGTTGTCACTCCAAAAATGTTGGTCAATTTCCTGGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTATTCTACAGTTGTCACTCCAAAAATGTTGGTCAATTTCCTGGCAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATAAATCTATTTCATTTCTTGGATGTGCAACACAGATGTTTCTTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AATAAATCTATTTCATTTCTTGGATGTGCAACACAGATGTTTCTTGCTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TACTTTTGGAACCACAGAATGCTTTCTCTTGGCTGCAATGGCTTATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TACTTTTGGAACCACAGAATGCTTTCTCTTGGCTGCAATGGCTTATGATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTATGTAGCCATCTACAACCCTCTCCTGTATTCAGTGAGCATGTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTATGTAGCCATCTACAACCCTCTCCTGTATTCAGTGAGCATGTCACCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGAGTCTATGTGCCACTCATCACTGCTTCCTATGTTGCTGGCATTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100451 AGAGTCTATGTGCCACTCATCACTGCTTCCTATGTTGCTAGCATTTTACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCTACTATACATACAGTGGCTACATTTAGCCTGTCCTTCTGTGGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGCTACTATACATACAGTGGCTACATTTAGCCTGTCCTTCTGTGGATCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGAAATTAGGCATGTCTTTTGTAATATGCCTCCTCTCCTTGCTATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100551 ATGAAATTAGGCATGTCTTTTGTAATATGCCTCCTCTGCTTGCTATTTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGTTCTGACACTCACGTAATCCAGCTTCTATTCTTCTACTTTGTGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGTTCTGACACTCACGTAATCCAGCTTCTATTCTTCTACTTTGTGGGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TATTGAGATAGTCACTATCCTGATTGTCCTGATCTCCTATGGTTTTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TATTGAGATAGTCACTATCCTGATTGTCCTGATCTCCTATGGTTTTATTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGTTGGCCATTCTGAAGATGCAGTCTGCTGAAGGGAGGAGAAAAGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGTTGGCCATTCTGAAGATGCAGTCTGCTGAAGGGAGGAGAAAAGTCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCTACATGTGGAGCTCACCTAACTGGAGTGACAATTTATCATGGGACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCTACATGTGGAGCTCACCTAACTGGAGTGACAATTTATCATGGGACAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTCTTCATGTATGTGAGACCAAGTTCCAGCTACACTTCGGACAATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTCTTCATGTATGTGAGACCAAGTTCCAGCTACACTTCGGACAATGACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGATAGTGTCAATATTTTATACCATTGTGATTCCCATGCTGAATCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGATAGTGTCAATATTTTATACCATTGTGATTCCCATGCTGAATCCCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATCTACAGTTTGCGGAACAAAGATGTAAAGGAGGCAATCAAAAGATTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATCTACAGTTTGCGGAACAAAGATGTAAAGGAGGCAATCAAAAGATTGCT

    950     .    :    .    :    .
    951 TGTGAGAAATTGGTTCATAAATAAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGTGAGAAATTGGTTCATAAATAAGTTA