seq1 = pF1KE6094.tfa, 978 bp
seq2 = pF1KE6094/gi568815587f_124470069.tfa (gi568815587f:124470069_124671046), 200978 bp

>pF1KE6094 978
>gi568815587f:124470069_124671046 (Chr11)

1-978  (100001-100978)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTTCTTGTCTCCCATGCATCCCTGCAGGCCTCCCACCCAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTTCTTGTCTCCCATGCATCCCTGCAGGCCTCCCACCCAGAGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATGGCTGCAGGAAATCACTCTACAGTGACAGAGTTCATTCTCAAGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATGGCTGCAGGAAATCACTCTACAGTGACAGAGTTCATTCTCAAGGGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAACGAAGAGAGCAGACCTCCAGCTCCCCCTCTTTCTCCTCTTCCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAACGAAGAGAGCAGACCTCCAGCTCCCCCTCTTTCTCCTCTTCCTCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCTACTTGGTCACCATCGTGGGGAACCTGGGCATGATCACTCTAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCTACTTGGTCACCATCGTGGGGAACCTGGGCATGATCACTCTAATTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTGAACTCTCAGCTGCACACCCCCATGTACTACTTTCTCAGCAATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTGAACTCTCAGCTGCACACCCCCATGTACTACTTTCTCAGCAATCTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CACTCATGGATCTCTGCTACTCCTCCGTCATTACCCCTAAGATGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CACTCATGGATCTCTGCTACTCCTCCGTCATTACCCCTAAGATGCTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACTTTGTGTCAGAGAAAAACATCATCTCCTACGCAGGGTGCATGTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACTTTGTGTCAGAGAAAAACATCATCTCCTACGCAGGGTGCATGTCACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTCTACTTCTTCCTTGTTTTTGTCATTGCTGAGTGTTACATGCTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTCTACTTCTTCCTTGTTTTTGTCATTGCTGAGTGTTACATGCTGACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATGGCCTACGACCGCTATGTTGCCATCTGCCACCCTTTGCTTTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGATGGCCTACGACCGCTATGTTGCCATCTGCCACCCTTTGCTTTACAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCATTATGTCTCATCACACCTGCCTGCTGCTGGTGGCTGTGGTCTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCATTATGTCTCATCACACCTGCCTGCTGCTGGTGGCTGTGGTCTACGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATCGGACTCATTGGCTCCACAATAGAAACTGGCCTCATGTTAAAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATCGGACTCATTGGCTCCACAATAGAAACTGGCCTCATGTTAAAACTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTATTGTGAGCACCTCATCAGTCACTACTTCTGTGACATCCTCCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTATTGTGAGCACCTCATCAGTCACTACTTCTGTGACATCCTCCCTCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGAAGCTGTCCTGCTCTAGCACCTATGATGTTGAGATGACAGTCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGAAGCTGTCCTGCTCTAGCACCTATGATGTTGAGATGACAGTCTTCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTCGGCTGGATTCAACATCATAGTCACGAGCTTAACAGTTCTTGTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTCGGCTGGATTCAACATCATAGTCACGAGCTTAACAGTTCTTGTTTCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACACCTTCATTCTCTCCAGCATCCTCGGCATCAGCACCACAGAGGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACACCTTCATTCTCTCCAGCATCCTCGGCATCAGCACCACAGAGGGGAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCAAAGCCTTCAGCACCTGCAGCTCCCACCTTGCAGCCGTGGGAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCCAAAGCCTTCAGCACCTGCAGCTCCCACCTTGCAGCCGTGGGAATGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTATGGATCAACTGCATTCATGTACTTAAAACCCTCCACAATCAGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTATGGATCAACTGCATTCATGTACTTAAAACCCTCCACAATCAGTTCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGACCCAGGAGAATGTGGCCTCTGTGTTCTACACCACGGTAATCCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGACCCAGGAGAATGTGGCCTCTGTGTTCTACACCACGGTAATCCCCATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTGAATCCCCTAATCTACAGCCTGAGGAACAAGGAAGTAAAGGCTGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTGAATCCCCTAATCTACAGCCTGAGGAACAAGGAAGTAAAGGCTGCCGT

    950     .    :    .    :    .
    951 GCAGAAAACGCTGAGGGGTAAACTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCAGAAAACGCTGAGGGGTAAACTGTTT