seq1 = pF1KE6093.tfa, 978 bp
seq2 = pF1KE6093/gi568815584r_19612939.tfa (gi568815584r:19612939_19813916), 200978 bp

>pF1KE6093 978
>gi568815584r:19612939_19813916 (Chr14)

(complement)

1-978  (100001-100978)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGTCCCTTGACCTTGCAGGTCACTGGCCTAATGAATGTCTCTGAGCC
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGTCCCTTGACCTTGCATGTCACTGGCCTAATGAATGTCTCTGAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAATTCCAGCTTTGCTTTTGTAAATGAATTTATACTCCAAGGTTTCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAATTCCAGCTTTGCTTTTGTAAATGAATTTATACTCCAAGGTTTCTCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGAGTGGACAATTCAGATCTTCCTCTTCTCACTCTTTACTACAACATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 100101 GTGAGTGGACAATTCAGATCTTCCTCTTCTCACTCTTTACTACAATATAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTACTGACTATAACAGGGAATGGAGCCATTGCTTTTGTCCTGTGGTGTGA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCACTGACTATAACAGGGAATGGAGCCATTGCTTTTGTCCTGTGGTGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGGCGACTTCACACTCCCATGTACATGTTCCTGGGAAATTTCTCCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGGCGACTTCACACTCCCATGTACATGTTCCTGGGAAATTTCTCCTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAGAGATATGGTATGTCTCTTCTACAGTTCCCAAGATGTTGGTCAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAGAGATATGGTATGTCTCTTCTACAGTTCCCAAGATGTTGGTCAACTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTTCAGAGAAAAAAAACATCTCCTTTGCTGGATGTTTTCTCCAGTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTTCAGAGAAAAAAAACATCTCCTTTGCTGGATGTTTTCTCCAGTTTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTCTTCTTCTCTTTGGGTACATCAGAATGCTTGCTTTTGACTGTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTCTTCTTCTCTTTGGGTACATCAGAATGCTTGCTTTTGACTGTGATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTTTGATCAGTACCTTGCTATCTGCCGTCCCTTGCTCTATCCTAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTTTGATCAGTACCTTGCTATCTGCCGTCCCTTGCTCTATCCTAATATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGACTGGGCATCTCTATGCCAAACTGGTCATACTGTGCTGGGTTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGACTGGGCATCTCTATGCCAAACTGGTCATACTGTGCTGGGTTTGTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTTCTGTGGTTCCTGATCCCCATTGTTCTCATCTCTCAGATGCCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100501 ATTTCTGTGGTTCCTGATCCCCATTGTTCTCATCTCTCAGAAGCCCTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGGCCCAAACATTATTGACCATGTTGTGTGTGACCCAGGGCCACGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 100551 GTGGCCCAAACATTATTGACCATGTTGTGTGTGACCCAGGGCCACTATTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCATTGGATTGTGTTTCTGCCCCAAGAATCCAACTGTTTTGCTACACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCATTGGATTGTGTTTCTGCCCCAAGAATCCAACTGTTTTGCTACACTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAGCTCATTAGTTATTTTTGGTAACTTCCTCTTTATTATTGGATCCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAGCTCATTAGTTATTTTTGGTAACTTCCTCTTTATTATTGGATCCTATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTCTTGTCCTGAAAGCTATGTTGGGTATGCCTTCAAGCACTGGGAGACAT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTCTTGTCCTGAAAGCTGTGTTGGGTATGCCTTCAAGCACTGGGAGACAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGGTCTTCTCTACCTGTGGGTCTCATTTGGCTGTGGTATCACTGTGCTA
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGGCCTTCTCTACCTGTGGGTCTCATTTGGCTGTGGTATCACTGTGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAGCTCTCTTATGGTCATGTATGTGAGCCCAGGACTCGGACATTCTACAG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAGCCCTCTTATGGTCATGTATGTGAGCCCAGGACTCGGACATTCTACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGATGCAGAAAATTGAAACTTTGTTCTATGCTATGGTGACCCCACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGATGCAGAAAATTGAAACTTTGTTCTATGCTATGGTGACCCCACTCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AATCCCCTTATCTATAGCCTCCAGAATAAGGAGATAAAGGCAGCCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AATCCCCTTATCTATAGCCTCCAGAATAAGGAGATAAAGGCAGCCCTGAG

    950     .    :    .    :    .
    951 GAAAGTTCTGGGGAGTTCCAACATAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAAAGTTCTGGGGAGTTCCAACATAATC