seq1 = pF1KE6092.tfa, 978 bp
seq2 = pF1KE6092/gi568815584f_19080291.tfa (gi568815584f:19080291_19281268), 200978 bp

>pF1KE6092 978
>gi568815584f:19080291_19281268 (Chr14)

1-978  (100001-100978)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGTCCCTTGACCTTGCAGGTCACTGGCCTAATGAATGTCTCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGTCCCTTGACCTTGCAGGTCACTGGCCTAATGAATGTCTCTGAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAATTCCAGCTTTGCTTTTGTAAATGAATTTATACTCCAAGGTTTCACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 100051 AAATTCCAGCTTTGCTTTTGTAAATGAATTTATACTCCAAGGTTTCTCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGAGTGGACAATTCAGATCTTCCTCTTCTCACTCTTTACTACAACATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 100101 GTGAGTGGACAATTCAGATCTTCCTCTTCTCACTCTTTACTACAATATAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCACTGACTATAACAGGGAATGGAGCCATTGCTTTTGTCCTGTGGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100151 GCACTGACTATAACAGGGAATGGAGCCATTGCTTTTGCCCTGTGGTGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGGCGACTTCACACTCCCATGTACATGTTCCTGGGAAATTTCTCCTTTT
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100201 CCGGCGACTTCACACTCCCATGTACATGTTCCTGGGAGATTTCTCCTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAGAGATATGGTATGTCTCTTCTACAGTTCCCAAGATGTTGGTCAACTTC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAGAGATATGGTATGTCTTTTCTACAGTTCCCAAGATGTTGGTCAACTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTTCAGAGAAAAAAAACATCTCCTTTGCTGGAT GTTTTCTCCAGTTTT
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||-|||||||||||||||
 100301 CTTTCAGAGAAAACAAACATCTCCTTTGCTGGATTGTTTTCTCCAGTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    350 ATTTCTTCTTCTCTTTGGGTACATCAGAATGCTTGCTTTTGACTGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ATTTCTTCTTCTCTTTGGGTACATCAGAATGCTTGCTTTTGACTGTGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    400 GCCTTTGATCAGTACCTTGCTATCTGCCGTCCCTTGCTCTATCCTAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100401 GCCTTTGATCAGTACCTTGCTATCTGCCGTCCCTTGCACTATCCTAATAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    450 CATGACTGGGCATCTCTGTGCCAAACTGGTCATACTGTGCTGGGTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CATGACTGGGCATCTCTGTGCCAAACTGGTCATACTGTGCTGGGTTTGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    500 GATTTCTGTGGTTCCTGATCCCCATTGTTCTCATCTCTCAGATGCCCTTC
        | ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||
 100501 GCTTTCTGTGGTTCCTGATCCCCATT TTCTCATCTCTCAGATGCCCTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    550 TGTGGCCCAAACATTATTGACCATGTTGTGTGTGACCCAGGGCCACGATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 100550 TGTGGCCCAAACATTATTGACCATGTTGTGTGTGACCCAGGGCCACTATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    600 TGCATTGGATTGTGTTTCTGCCCCAAGAATCCAACTGTTTTGCTACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100600 TGCATTGGATTGTGTTTCTGCCCCAAGAATCCAACTGTTTTGCTACACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    650 TAAGCTCATTAGTTATTTTTGGTAACTTCCTCTTTATTATTGGATCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100650 TAAGCTCATTAGTTATTTTTGGTAACTTCCTCTTTATTATTGGATCCTAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    700 ACTCTTGTCCTGAAAGCTGTGTTGGGTATGCCTTCAAGCACTGGGAGACA
        ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100700 ACTATTGTCCTGAAAGTTGTGTTGGGTACGCCTTCAAGCACTGGGAGACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    750 TAAGGCCTTCTCTACCTGTGGGTCTCATTTGGCTGTGGTATCACTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100750 TAAGGCCTTCTCTACCTGTGGGTCTCATTTGGCTGTGGTATCACTGTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    800 ATAGCTCTCTTATGGTCATGTATGTGAGCCCAGGACTCGGACATTCTACA
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100800 ATGGCTCTCTTATGGTCATGTATGTGAGCCCAGGACTCGGACATTCTACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    850 GGGATGCAGAAAATTGAAACTTTGTTCTATGCTATGGTGACCCCACTCTT
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100850 GGGATGCAGAAAATTGTAACTTTGTTCTATGCTATGGTGACCCCACTCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    900 CAATCCCCTTATCTATAGCCTCCAGAATAAGGAGATAAAGGCAGCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100900 CAATCCCCTTATCTATAGCCTCCAGAATAAGGAGATAAAGGCAGCCCTGA

    950     .    :    .    :    .
    950 GGAAAGTTCTGGGAAGTTCCAACATAATC
        ||||||||||||| |||||||||||||||
 100950 GGAAAGTTCTGGGGAGTTCCAACATAATC