seq1 = pF1KE6089.tfa, 975 bp
seq2 = pF1KE6089/gi568815587f_58114745.tfa (gi568815587f:58114745_58315719), 200975 bp

>pF1KE6089 975
>gi568815587f:58114745_58315719 (Chr11)

1-975  (100001-100975)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGACTTTTAGTTCCTTTCTTCAGATCGGCAGAAATATGCATCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGACTTTTAGTTCCTTTCTTCAGATCGGCAGAAATATGCATCAAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAACCAAACCACCATCACTGAATTCATTCTCCTGGGATTTTTCAAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAACCAAACCACCATCACTGAATTCATTCTCCTGGGATTTTTCAAGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGAGCATCAAAACCTCCTCTTTGTGCTTTTCTTGGGTATGTACCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGAGCATCAAAACCTCCTCTTTGTGCTTTTCTTGGGTATGTACCTGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTGTGATTGGGAACGGGCTCATCATTGTGGCTATCAGCTTGGATACGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACTGTGATTGGGAACGGGCTCATCATTGTGGCTATCAGCTTGGATACGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTTCATACCCCCATGTATCTCTTCCTTGCCAATCTATCCTTTGCTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTTCATACCCCCATGTATCTCTTCCTTGCCAATCTATCCTTTGCTGATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTCCTCCATTTCCAACTCAGTCCCCAAAATGCTGGTGAATATTCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTTCCTCCATTTCCAACTCAGTCCCCAAAATGCTGGTGAATATTCAAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGAGTCAATCCATCTCTTATGAGAGCTGCATCACACAGATGTACTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGAGTCAATCCATCTCTTATGAGAGCTGCATCACACAGATGTACTTTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TATTGTGTTTGTCGTCATTGACAATTTGCTCTTGGGGACCATGGCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TATTGTGTTTGTCGTCATTGACAATTTGCTCTTGGGGACCATGGCCTATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCACTTTGTGGCGATCTGCCACCCTCTGAATTATACAATTCTCATGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCACTTTGTGGCGATCTGCCACCCTCTGAATTATACAATTCTCATGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCAGGTTCGGCATTTTGCTCACAGTCATCTCATGGTTCCTCAGTAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCAGGTTCGGCATTTTGCTCACAGTCATCTCATGGTTCCTCAGTAATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TATTGCTCTGACACACACCCTTCTGCTCATTCAATTGCTCTTCTGTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TATTGCTCTGACACACACCCTTCTGCTCATTCAATTGCTCTTCTGTAACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACAACACTCTCCCACACTTCTTCTGTGACTTGGCCCCTCTGCTCAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACAACACTCTCCCACACTTCTTCTGTGACTTGGCCCCTCTGCTCAAACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCTGTTCAGATACATTGATCAATGAGCTTGTGTTGTTTATTGTGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCTGTTCAGATACATTGATCAATGAGCTTGTGTTGTTTATTGTGGGTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATCAGTTATCATCTTCCCCTTTACACTCAGCTTCTTTTCCTATGTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ATCAGTTATCATCTTCCCCTTTACACTCAGCTTCTTTTCCTATGTCTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCATCAGAGCTGTCCTGAGAGTATCTTCCACACAGGGAAAGTGGAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCATCAGAGCTGTCCTGAGAGTATCTTCCACACAGGGAAAGTGGAAAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTCCACTTGTGGCTCTCACCTGACAGTTGTATTACTGTTCTACGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTCCACTTGTGGCTCTCACCTGACAGTTGTATTACTGTTCTACGGAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATTGTAGGCGTGTACTTTTTCCCCTCCTCCACTCACCCTGAGGACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATTGTAGGCGTGTACTTTTTCCCCTCCTCCACTCACCCTGAGGACACTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATAAGATTGGTGCTGTCCTATTCACTGTGGTGACACCCATGATAAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATAAGATTGGTGCTGTCCTATTCACTGTGGTGACACCCATGATAAACCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCATCTACAGCTTGAGGAATAAGGATATGAAAGGTGCCCTGAGAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCATCTACAGCTTGAGGAATAAGGATATGAAAGGTGCCCTGAGAAAGCT

    950     .    :    .    :    .
    951 CATCAATAGAAAAATTTCTTCCCTT
        |||||||||||||||||||||||||
 100951 CATCAATAGAAAAATTTCTTCCCTT