seq1 = pF1KE6087.tfa, 975 bp
seq2 = pF1KE6087/gi568815587r_58103207.tfa (gi568815587r:58103207_58304181), 200975 bp

>pF1KE6087 975
>gi568815587r:58103207_58304181 (Chr11)

(complement)

1-975  (100001-100975)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGACTTTGTGTTCCTTTCTTCAGATCAGCAGAAATATGCATCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGACTTTGTGTTCCTTTCTTCAGATCAGCAGAAATATGCATCAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAACCAAACCACCATCACTGAATTCATTCTCCTGGGACTCTCCAACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAACCAAACCACCATCACTGAATTCATTCTCCTGGGACTCTCCAACCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAACATCAAAACCTCCTCTTTGTGCTTTTCCTGAGTATGTATGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAACATCAAAACCTCCTCTTTGTGCTTTTCCTGAGTATGTATGTGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTGTGGTTGGGAACGGGCTCATCATTGTGGCTATCAGCTTGGATATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACTGTGGTTGGGAACGGGCTCATCATTGTGGCTATCAGCTTGGATATATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTTCACACCCCCATGTATCTCTTCCTTGCCTACCTATCCTTTGCTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTTCACACCCCCATGTATCTCTTCCTTGCCTACCTATCCTTTGCTGATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTCCTCCATTTCCAACTCAGTCCCCAAAATGCTGGTGAATATTCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTTCCTCCATTTCCAACTCAGTCCCCAAAATGCTGGTGAATATTCAAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACAGCCAATCCATCTCTTATGAGAGCTGCATCACACAGATGTACTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACAGCCAATCCATCTCTTATGAGAGCTGCATCACACAGATGTACTTTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TATTGTGTTTGTCGTCACTGACAATTTGCTTTTGGGGACCATGGCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TATTGTGTTTGTCGTCACTGACAATTTGCTTTTGGGGACCATGGCCTTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCACTTTGTGGCGATCTGCCACCCTCTGAACTATACAACTTTCATGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCACTTTGTGGCGATCTGCCACCCTCTGAACTATACAACTTTCATGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCAGGTTCGGCACTTTGCTCACAGTCATCTCGTGGTTCCTCAGTAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCAGGTTCGGCACTTTGCTCACAGTCATCTCGTGGTTCCTCAGTAATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TATTGCTCTTACACACACCCTTCTGCTCATTCAATTGCTCTTCTGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TATTGCTCTTACACACACCCTTCTGCTCATTCAATTGCTCTTCTGTGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACAACACTCTCCCACACTTCTTCTGTGACTTGGCCCCTCTGCTCAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACAACACTCTCCCACACTTCTTCTGTGACTTGGCCCCTCTGCTCAAACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCTGTTCAGATACAATGATCAATGAGCTTGTGTTGTTTATTGTGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCTGTTCAGATACAATGATCAATGAGCTTGTGTTGTTTATTGTGGGTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATCAGTTATCATCTTCCCCTTTGTACTCATCTTCTTCTCCTATGTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ATCAGTTATCATCTTCCCCTTTGTACTCATCTTCTTCTCCTATGTCTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCATCAGAGCTGTCCTGGGAGTATCATCCACACAGGGAAAGTGGAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCATCAGAGCTGTCCTGGGAGTATCATCCACACAGGGAAAGTGGAAAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTCCACTTGTGGCTCTCACCTGACAATTGCATTACTGTTCTACGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTCCACTTGTGGCTCTCACCTGACAATTGCATTACTGTTCTACGGAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CACTGTAGGCGTGTACTTTTTCCCCTCCTCCACTCACCCTGAGGACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CACTGTAGGCGTGTACTTTTTCCCCTCCTCCACTCACCCTGAGGACACTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATAAGATTGGTGCTGTCCTATTCACTGTGGTGACACCCATGATGAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATAAGATTGGTGCTGTCCTATTCACTGTGGTGACACCCATGATGAACCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCATCTACAGCTTGAGGAATAAGGATATGAAAGGTGCCCTGAGAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCATCTACAGCTTGAGGAATAAGGATATGAAAGGTGCCCTGAGAAAGCT

    950     .    :    .    :    .
    951 CATCAATAGAAAAATTTCTTCCCTT
        |||||||||||||||||||||||||
 100951 CATCAATAGAAAAATTTCTTCCCTT