seq1 = pF1KE6086.tfa, 972 bp
seq2 = pF1KE6086/gi568815597r_158599681.tfa (gi568815597r:158599681_158800652), 200972 bp

>pF1KE6086 972
>gi568815597r:158599681_158800652 (Chr1)

(complement)

1-972  (100001-100972)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGCCCCAATCGAACCACCATTCAGGAGTTTATCTTCTCCGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAGCCCCAATCGAACCACCATTCAGGAGTTTATCTTCTCCGCTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCTTATTCCTGGGTTAAGTCTGTTGTCTGCTTTGTTCCACTGCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCTTATTCCTGGGTTAAGTCTGTTGTCTGCTTTGTTCCACTGCTCTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATGCTTTCATTGTTGTTGGAAACCTGGTCATCATCACAGTGGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATGCTTTCATTGTTGTTGGAAACCTGGTCATCATCACAGTGGTCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGAATACTCACCTCCACACTCCCATGTATACTTTTATCAGTGCTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGAATACTCACCTCCACACTCCCATGTATACTTTTATCAGTGCTCTTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTCCTGGAGATTTGGTATACCACAGCCACAATCCCAAAGATGCTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTCCTGGAGATTTGGTATACCACAGCCACAATCCCAAAGATGCTGTCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTGCTTAGTGAGAGGAGCATTTCCTTCAATGGTTGTCTCCTGCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTGCTTAGTGAGAGGAGCATTTCCTTCAATGGTTGTCTCCTGCAGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TATTTCTTCCATTCCACCGGCATCTGTGAGGTGTGTCTCTTGACAGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TATTTCTTCCATTCCACCGGCATCTGTGAGGTGTGTCTCTTGACAGTTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCTTTGACCACTACCTGGCCATATGCAGCCCTCTTCATTATCCCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCTTTGACCACTACCTGGCCATATGCAGCCCTCTTCATTATCCCTCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATGACCCCCAAGCTATGTACCCAACTGACTTTAAGTTGCTGTGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATGACCCCCAAGCTATGTACCCAACTGACTTTAAGTTGCTGTGTTTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCTTTATCACACCCCTTCCTGAGATTGCCTGGATCTCTACACTGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCTTTATCACACCCCTTCCTGAGATTGCCTGGATCTCTACACTGCCATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTGTGGTTCGAATCACCTTGAACATATCTTCTGTGACTTCCTCCCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTGTGGTTCGAATCACCTTGAACATATCTTCTGTGACTTCCTCCCAGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCGTCTGGCCTGCACAGACACACGAGCCATCGTCATGATTCAGGTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCGTCTGGCCTGCACAGACACACGAGCCATCGTCATGATTCAGGTAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATGTCATTCATGCAGTGGAGATTATTACAGCTGTGATGCTCATCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GATGTCATTCATGCAGTGGAGATTATTACAGCTGTGATGCTCATCTTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTCCTACGATGGTATTGTGGCTGTAATTCTACGTATTCATTCAGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTCCTACGATGGTATTGTGGCTGTAATTCTACGTATTCATTCAGCTGGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCCGCCGCACAGCATTTTCCACGTGTGTCTCTCACTTCATTGTCTTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCCGCCGCACAGCATTTTCCACGTGTGTCTCTCACTTCATTGTCTTTTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCTTCTTTGGCAGTGTGACTCTCATGTACCTACGCTTCTCTGCCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCTTCTTTGGCAGTGTGACTCTCATGTACCTACGCTTCTCTGCCACCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCTTTGTTCTGGGATATAGCCATTGCTCTGGCCTTTGCAGTTTTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTCTTTGTTCTGGGATATAGCCATTGCTCTGGCCTTTGCAGTTTTGTCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTTCTTCAACCCCATTATCTATAGCCTGAGGAATAAAGAAATAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCTTCTTCAACCCCATTATCTATAGCCTGAGGAATAAAGAAATAAAAGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCTATAAAAAAGCACATAGGTCAAGCTAAGATATTTTTTTCCGTAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCTATAAAAAAGCACATAGGTCAAGCTAAGATATTTTTTTCCGTAAGACC

    950     .    :    .    :
    951 AGGGACCTCAAGTAAGATATTT
        ||||||||||||||||||||||
 100951 AGGGACCTCAAGTAAGATATTT