seq1 = pF1KE6080.tfa, 972 bp
seq2 = pF1KE6080/gi568815587r_56317261.tfa (gi568815587r:56317261_56518232), 200972 bp

>pF1KE6080 972
>gi568815587r:56317261_56518232 (Chr11)

(complement)

1-972  (100001-100972)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAAGTTAATATCATTTATGTCACTGTATTCATTCTGAAAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAAGTTAATATCATTTATGTCACTGTATTCATTCTGAAAGGAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACCAACCGGCCAGAGCTTCAGGCCCCGTGCTTTGGGGTGTTTTTAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACCAACCGGCCAGAGCTTCAGGCCCCGTGCTTTGGGGTGTTTTTAGTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATCTGGTCACAGTGCTGGGCAATCTTGGGTTGATTACTTTAATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATCTGGTCACAGTGCTGGGCAATCTTGGGTTGATTACTTTAATCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGATACTCGACTCCACACACCTATGTACTATTTCCTCAGCCACCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTGATACTCGACTCCACACACCTATGTACTATTTCCTCAGCCACCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTGTTGACCTTTGTTACTCCTCTGCTATTACACCGAAGATGATGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTGTTGACCTTTGTTACTCCTCTGCTATTACACCGAAGATGATGGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTTTGTTGTGGAACGCAACACCATTCCTTTCCATGCTTGTGCAACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTTTGTTGTGGAACGCAACACCATTCCTTTCCATGCTTGTGCAACCCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGGTTATTTTCTCACCTTCATGATCACTGAGTGTTTCCTTCTAGCCTC
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGGTTGTTTTCTCACCTTCATGATCACTGAGTGTTTCCTTCTAGCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGCCTACGGTCGCTATGTCGCCATCTGTAGTCCCCTGCATTATTCAA
        ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGCCTACGATTGCTATGTCGCCATCTGTAGTCCCCTGCATTATTCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CACTGATGTCAAGAAGAGTCTGCATTCAACTGGTGGCAGTTCCATATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CACTGATGTCAAGAAGAGTCTGCATTCAACTGGTGGCAGTTCCATATATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACAGCTTCCTGGTTGCCCTCTTCCACACCGTTATCACTTTCCGTCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACAGCTTCCTGGTTGCCCTCTTCCACACCGTTATCACTTTCCGTCTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTACTGTGGCCCAAACTTAATTAACCATTTCTATTGTGATGACCTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTACTGTGGCCCAAACTTAATTAACCATTTCTATTGTGATGACCTCCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTTAGCTCTGTCCTGCTCAGACACACACATGAAGGAAATTCTGATATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTTAGCTCTGTCCTGCTCAGACACACACATGAAGGAAATTCTGATATTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCTTTGCTGGCTTTGATATGATCTCTTCCTCTTCCATTGTCCTCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCTTTGCTGGCTTTGATATGATCTCTTCCTCTTCCATTGTCCTCACCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACATCTTTATTATTGCCGCTATCCTAAGGATCCGCTCTACTCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACATCTTTATTATTGCCGCTATCCTAAGGATCCGCTCTACTCAGGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AACACAAAGCCATTTCCACCTGTGGCTCCCATATGGTGACTGTCACTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AACACAAAGCCATTTCCACCTGTGGCTCCCATATGGTGACTGTCACTATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGCACACTGATCTTTATGTACCTACAGCCCAAATCAAATCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGCACACTGATCTTTATGTACCTACAGCCCAAATCAAATCACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTTGGACACAGACAAGATGGCTTCTGTATTTTACACAGTGGTGATCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTTGGACACAGACAAGATGGCTTCTGTATTTTACACAGTGGTGATCCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTTAAACCCCCTAATCTATAGTCTAAGGAACAAAGAAGTGAAAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTTAAACCCCCTAATCTATAGTCTAAGGAACAAAGAAGTGAAAGATGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCAAAGAAAGCCTTGGATAAAGGTTGTGAAAACTTACAGATATTAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCAAAGAAAGCCTTGGATAAAGGTTGTGAAAACTTACAGATATTAACATT

    950     .    :    .    :
    951 TTTAAAAATAAGAAAACTTTAT
        ||||||||||||||||||||||
 100951 TTTAAAAATAAGAAAACTTTAT