seq1 = pF1KE6078.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KE6078/gi568815587r_6069358.tfa (gi568815587r:6069358_6270326), 200969 bp

>pF1KE6078 969
>gi568815587r:6069358_6270326 (Chr11)

(complement)

1-969  (100001-100969)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCACACCAATGTTACCATCTTCCATCCTGCAGTTTTTGTCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTCACACCAATGTTACCATCTTCCATCCTGCAGTTTTTGTCCTTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCATCCCTGGGTTGGAGGCTTATCACATTTGGCTGTCAATACCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCATCCCTGGGTTGGAGGCTTATCACATTTGGCTGTCAATACCTCTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTCATTTACATCACTGCAGTCCTGGGAAACAGCATCCTGATAGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTCATTTACATCACTGCAGTCCTGGGAAACAGCATCCTGATAGTGGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGTCATGGAACGTAACCTTCATGTGCCCATGTATTTCTTCCTCTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTGTCATGGAACGTAACCTTCATGTGCCCATGTATTTCTTCCTCTCAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGGCCGTCATGGACATCCTGCTGTCTACCACCACTGTGCCCAAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGGCCGTCATGGACATCCTGCTGTCTACCACCACTGTGCCCAAGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAGCCATCTTTTGGCTTCAAGCACATAACATTGCTTTTGATGCCTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAGCCATCTTTTGGCTTCAAGCACATAACATTGCTTTTGATGCCTGTGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCCAAGGCTTCTTTGTCCATATGATGTTTGTGGGGGAGTCAGCTATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCCAAGGCTTCTTTGTCCATATGATGTTTGTGGGGGAGTCAGCTATCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTTAGCCATGGCCTTTGATCGCTTTGTGGCCATTTGTGCCCCACTGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTTAGCCATGGCCTTTGATCGCTTTGTGGCCATTTGTGCCCCACTGAGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATACAACAGTGCTAACATGGCCTGTTGTGGGGAGGATTGCTCTGGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATACAACAGTGCTAACATGGCCTGTTGTGGGGAGGATTGCTCTGGCCGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCACCCGAAGCTTCTGCATCATCTTCCCAGTCATATTCTTGCTGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCACCCGAAGCTTCTGCATCATCTTCCCAGTCATATTCTTGCTGAAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTGCCCTTCTGCCTAACCAACATTGTTCCTCACTCCTACTGTGAGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGCCCTTCTGCCTAACCAACATTGTTCCTCACTCCTACTGTGAGCATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGGAGTGGCTCGTTTAGCCTGTGCTGACATCACTGTTAACATTTGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGGAGTGGCTCGTTTAGCCTGTGCTGACATCACTGTTAACATTTGGTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCTTCTCAGTGCCCATTGTCATGGTCATCTTGGATGTTATCCTCATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCTTCTCAGTGCCCATTGTCATGGTCATCTTGGATGTTATCCTCATCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTGTCTTACTCACTGATCCTCCGAGCAGTGTTTCGTTTGCCCTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTGTCTTACTCACTGATCCTCCGAGCAGTGTTTCGTTTGCCCTCCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGCTCGGCACAAGGCCCTCAGCACTTGTGGCTCCCACCTCTGTGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGCTCGGCACAAGGCCCTCAGCACTTGTGGCTCCCACCTCTGTGTCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTTATGTTTTATGTTCCATCCTTCTTTACCTTATTGACCCATCATTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTTATGTTTTATGTTCCATCCTTCTTTACCTTATTGACCCATCATTTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCGTAATATTCCTCAACATGTCCATATCTTGCTGGCCAATCTTTATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCGTAATATTCCTCAACATGTCCATATCTTGCTGGCCAATCTTTATGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CAGTGCCACCAATGCTGAACCCCATTGTCTATGGTGTGAAGACTAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CAGTGCCACCAATGCTGAACCCCATTGTCTATGGTGTGAAGACTAAGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATACGTGAGGGTGTAGCCCACCGGTTCTTTGACATCAAGACTTGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATACGTGAGGGTGTAGCCCACCGGTTCTTTGACATCAAGACTTGGTGCTG

    950     .    :    .
    951 TACCTCCCCTCTGGGCTCA
        |||||||||||||||||||
 100951 TACCTCCCCTCTGGGCTCA